diff --git a/R/bioc_to_zarr.R b/R/bioc_to_zarr.R index 157dd2e..9c08ee9 100644 --- a/R/bioc_to_zarr.R +++ b/R/bioc_to_zarr.R @@ -19,7 +19,7 @@ sce_to_anndata_zarr <- function(sce_obj, out_path) { } store <- pizzarr::DirectoryStore$new(out_path) - anndataR::from_SingleCellExperiment(sce_obj, "ZarrAnnData", store = store) + anndataR::from_SingleCellExperiment(sce_obj, "ZarrAnnData", store = store, to_dense = TRUE) return(TRUE) }