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pbrevis/Mapa-ligamiento-genetico

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Construcción de un mapa de ligamiento genético

Este repositorio contiene códigos de programación en lenguaje R para construir un mapa de ligamiento genético en especies vegetales tetraploides.

El código fue desarrollado usando el paquete polymapR. El set de datos proviene del trabajo de Bourke et al (2018), y consiste en datos simulados de una especie vegetal xenogámica tetraploide con cinco cromosomas (número haploide X=5). La población contiene 207 individuos originados de una cruza F1 entre dos padres no endocriados.

Referencia: Peter M Bourke, Geert van Geest, Roeland E Voorrips, Johannes Jansen, Twan Kranenburg, Arwa Shahin, Richard G F Visser, Paul Arens, Marinus J M Smulders y Chris Maliepaard. 2018. polymapR—linkage analysis and genetic map construction from F1 populations of outcrossing polyploids. Bioinformatics 34(20):3496–3502. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty371

Mapa final

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Mapa de ligamiento genético

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