-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 1
/
Copy pathpotential.xvg
716 lines (716 loc) · 20.2 KB
/
potential.xvg
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
# This file was created Sat Apr 17 00:00:36 2021
# Created by:
# :-) GROMACS - gmx energy, 2020.1-Ubuntu-2020.1-1 (-:
#
# Executable: /usr/bin/gmx
# Data prefix: /usr
# Working dir: /home/dhnchandan/Notebooks/Bioinformatics/Gromacs/gromacs-experimet
# Command line:
# gmx energy -f em.edr -o potential.xvg
# gmx energy is part of G R O M A C S:
#
# Gromacs Runs On Most of All Computer Systems
#
@ title "GROMACS Energies"
@ xaxis label "Time (ps)"
@ yaxis label "(kJ/mol)"
@TYPE xy
@ view 0.15, 0.15, 0.75, 0.85
@ legend on
@ legend box on
@ legend loctype view
@ legend 0.78, 0.8
@ legend length 2
@ s0 legend "Potential"
0.000000 -331128.406250
1.000000 -347219.250000
2.000000 -369612.687500
3.000000 -398136.812500
4.000000 -426792.875000
5.000000 -451891.750000
6.000000 -458236.312500
7.000000 -463884.687500
8.000000 -464299.843750
9.000000 -469596.500000
11.000000 -474480.187500
12.000000 -475813.750000
13.000000 -479974.125000
15.000000 -482322.625000
16.000000 -483897.812500
17.000000 -486248.375000
18.000000 -486341.656250
19.000000 -488635.781250
21.000000 -491648.187500
22.000000 -491744.812500
23.000000 -495446.750000
25.000000 -496875.562500
26.000000 -497349.875000
27.000000 -498711.062500
29.000000 -500749.406250
30.000000 -501623.250000
31.000000 -504063.625000
33.000000 -505053.281250
34.000000 -505734.687500
35.000000 -506659.468750
36.000000 -506882.937500
37.000000 -507637.281250
39.000000 -509749.968750
40.000000 -510252.500000
41.000000 -512863.437500
43.000000 -513516.500000
44.000000 -514010.687500
45.000000 -514510.500000
46.000000 -514683.562500
47.000000 -514883.750000
49.000000 -517200.375000
50.000000 -517369.250000
51.000000 -520303.750000
53.000000 -520689.156250
54.000000 -521080.031250
55.000000 -521248.437500
56.000000 -521382.375000
58.000000 -523201.593750
59.000000 -523746.750000
60.000000 -525888.625000
62.000000 -526223.500000
63.000000 -526560.750000
64.000000 -526758.625000
65.000000 -526902.875000
67.000000 -528212.562500
68.000000 -529136.312500
69.000000 -530837.750000
71.000000 -531089.000000
72.000000 -531494.000000
73.000000 -531549.625000
74.000000 -531936.125000
76.000000 -532720.625000
77.000000 -532908.375000
78.000000 -533866.125000
80.000000 -534187.750000
81.000000 -534397.625000
82.000000 -534701.500000
83.000000 -534754.687500
84.000000 -535001.500000
86.000000 -535847.500000
87.000000 -535988.375000
88.000000 -537034.500000
90.000000 -537290.000000
91.000000 -537478.812500
92.000000 -537688.625000
93.000000 -537745.937500
94.000000 -537860.375000
96.000000 -538784.750000
97.000000 -538891.625000
98.000000 -540047.250000
100.000000 -540239.625000
101.000000 -540419.812500
102.000000 -540537.437500
103.000000 -540606.937500
105.000000 -541357.437500
106.000000 -541920.187500
107.000000 -542909.125000
109.000000 -543061.250000
110.000000 -543295.812500
111.000000 -543338.250000
112.000000 -543555.562500
114.000000 -544039.375000
115.000000 -544177.000000
116.000000 -544786.500000
118.000000 -544979.250000
119.000000 -545117.000000
120.000000 -545288.437500
121.000000 -545343.062500
122.000000 -545462.375000
124.000000 -546021.937500
125.000000 -546182.562500
126.000000 -546898.687500
128.000000 -547049.125000
129.000000 -547189.062500
130.000000 -547291.125000
131.000000 -547363.812500
132.000000 -547377.500000
134.000000 -548031.750000
135.000000 -548265.000000
136.000000 -549104.000000
138.000000 -549208.750000
139.000000 -549353.625000
140.000000 -549386.062500
141.000000 -549476.125000
143.000000 -549969.000000
144.000000 -550073.500000
145.000000 -550734.875000
147.000000 -550845.250000
148.000000 -550978.062500
149.000000 -551027.500000
150.000000 -551123.062500
152.000000 -551526.312500
153.000000 -551687.125000
154.000000 -552215.125000
156.000000 -552328.812500
157.000000 -552445.125000
158.000000 -552520.000000
159.000000 -552592.625000
161.000000 -552944.375000
162.000000 -553265.625000
163.000000 -553733.062500
165.000000 -553839.312500
166.000000 -553963.625000
167.000000 -554022.625000
168.000000 -554126.312500
170.000000 -554405.937500
171.000000 -554601.625000
172.000000 -554967.687500
174.000000 -555076.250000
175.000000 -555181.062500
176.000000 -555264.937500
177.000000 -555339.125000
178.000000 -555371.562500
179.000000 -555377.500000
181.000000 -555849.500000
182.000000 -555920.250000
183.000000 -556563.562500
185.000000 -556623.375000
186.000000 -556730.875000
188.000000 -556934.875000
189.000000 -557112.687500
190.000000 -557380.750000
192.000000 -557483.750000
193.000000 -557577.625000
194.000000 -557663.875000
195.000000 -557730.250000
196.000000 -557783.000000
197.000000 -557797.000000
199.000000 -558158.875000
200.000000 -558368.125000
201.000000 -558861.250000
203.000000 -558923.625000
204.000000 -559023.375000
205.000000 -559033.687500
206.000000 -559105.625000
208.000000 -559395.250000
209.000000 -559419.750000
210.000000 -559814.937500
212.000000 -559891.000000
213.000000 -559963.562500
214.000000 -560006.875000
215.000000 -560045.500000
217.000000 -560324.125000
218.000000 -560473.500000
219.000000 -560849.750000
221.000000 -560916.750000
222.000000 -561001.687500
223.000000 -561032.437500
224.000000 -561101.937500
226.000000 -561324.250000
227.000000 -561435.187500
228.000000 -561708.250000
230.000000 -561788.437500
231.000000 -561856.062500
232.000000 -561923.000000
233.000000 -561963.625000
234.000000 -562004.625000
236.000000 -562246.000000
237.000000 -562405.937500
238.000000 -562704.625000
240.000000 -562771.625000
241.000000 -562844.375000
242.000000 -562893.062500
243.000000 -562942.250000
244.000000 -562956.750000
246.000000 -563218.000000
247.000000 -563463.125000
248.000000 -563784.875000
250.000000 -563843.000000
251.000000 -563917.875000
252.000000 -563950.000000
253.000000 -564008.125000
255.000000 -564190.375000
256.000000 -564316.125000
257.000000 -564558.375000
259.000000 -564622.125000
260.000000 -564693.062500
261.000000 -564734.625000
262.000000 -564798.687500
263.000000 -564800.312500
264.000000 -564842.375000
266.000000 -565094.937500
268.000000 -565196.375000
269.000000 -565291.625000
270.000000 -565324.187500
271.000000 -565431.500000
273.000000 -565525.000000
274.000000 -565587.750000
275.000000 -565701.937500
277.000000 -565775.250000
278.000000 -565840.750000
279.000000 -565918.500000
280.000000 -565951.875000
281.000000 -566029.625000
283.000000 -566142.750000
284.000000 -566235.625000
285.000000 -566381.125000
287.000000 -566447.750000
288.000000 -566505.625000
289.000000 -566566.500000
290.000000 -566610.250000
291.000000 -566654.187500
292.000000 -566674.625000
293.000000 -566682.875000
295.000000 -566933.500000
296.000000 -567016.000000
297.000000 -567353.000000
299.000000 -567389.375000
300.000000 -567461.000000
302.000000 -567557.125000
303.000000 -567644.437500
304.000000 -567761.187500
306.000000 -567824.187500
307.000000 -567879.750000
308.000000 -567940.625000
309.000000 -567976.625000
310.000000 -568036.000000
311.000000 -568037.250000
312.000000 -568082.687500
314.000000 -568274.437500
315.000000 -568276.125000
316.000000 -568524.937500
318.000000 -568574.625000
319.000000 -568614.875000
320.000000 -568652.000000
321.000000 -568665.500000
322.000000 -568674.562500
324.000000 -568906.375000
325.000000 -568937.500000
326.000000 -569235.875000
328.000000 -569273.437500
329.000000 -569324.312500
330.000000 -569335.500000
331.000000 -569365.500000
333.000000 -569544.125000
334.000000 -569591.250000
335.000000 -569835.750000
337.000000 -569875.125000
338.000000 -569927.812500
339.000000 -569943.125000
340.000000 -569989.187500
342.000000 -570128.375000
343.000000 -570178.750000
344.000000 -570357.437500
346.000000 -570405.125000
347.000000 -570445.500000
348.000000 -570486.187500
349.000000 -570507.625000
350.000000 -570529.750000
352.000000 -570695.562500
353.000000 -570780.125000
354.000000 -570993.750000
356.000000 -571032.750000
357.000000 -571079.500000
358.000000 -571102.500000
359.000000 -571135.000000
361.000000 -571266.875000
362.000000 -571363.062500
363.000000 -571541.500000
365.000000 -571582.812500
366.000000 -571632.875000
367.000000 -571655.875000
368.000000 -571700.750000
370.000000 -571802.500000
371.000000 -571877.000000
372.000000 -572005.625000
374.000000 -572052.000000
375.000000 -572092.375000
376.000000 -572133.500000
377.000000 -572158.500000
378.000000 -572188.875000
380.000000 -572307.125000
381.000000 -572413.000000
382.000000 -572565.875000
384.000000 -572607.875000
385.000000 -572650.000000
386.000000 -572680.062500
387.000000 -572711.687500
388.000000 -572722.125000
389.000000 -572728.125000
391.000000 -572911.562500
392.000000 -572946.000000
393.000000 -573196.750000
395.000000 -573218.625000
396.000000 -573270.187500
398.000000 -573343.312500
399.000000 -573404.937500
400.000000 -573497.187500
402.000000 -573541.062500
403.000000 -573580.250000
404.000000 -573623.875000
405.000000 -573647.750000
406.000000 -573688.375000
408.000000 -573773.000000
409.000000 -573850.812500
410.000000 -573958.437500
412.000000 -574000.500000
413.000000 -574038.625000
414.000000 -574074.750000
415.000000 -574101.750000
416.000000 -574128.125000
417.000000 -574131.312500
418.000000 -574138.062500
420.000000 -574320.125000
422.000000 -574388.250000
423.000000 -574456.250000
424.000000 -574464.687500
425.000000 -574543.250000
427.000000 -574599.875000
428.000000 -574623.375000
429.000000 -574691.687500
431.000000 -574741.187500
432.000000 -574775.750000
433.000000 -574832.625000
434.000000 -574837.125000
435.000000 -574897.375000
437.000000 -574971.125000
438.000000 -574995.000000
439.000000 -575089.500000
441.000000 -575131.375000
442.000000 -575161.625000
443.000000 -575204.375000
444.000000 -575217.375000
445.000000 -575252.750000
447.000000 -575347.375000
448.000000 -575392.375000
449.000000 -575518.750000
451.000000 -575554.375000
452.000000 -575590.000000
453.000000 -575615.375000
454.000000 -575642.437500
455.000000 -575648.812500
456.000000 -575657.812500
458.000000 -575812.750000
459.000000 -575825.500000
460.000000 -576025.125000
462.000000 -576050.125000
463.000000 -576083.562500
464.000000 -576092.125000
465.000000 -576110.625000
467.000000 -576235.937500
468.000000 -576266.750000
469.000000 -576437.375000
471.000000 -576464.375000
472.000000 -576501.625000
473.000000 -576509.625000
474.000000 -576541.375000
476.000000 -576639.437500
477.000000 -576671.500000
478.000000 -576796.000000
480.000000 -576828.875000
481.000000 -576857.875000
482.000000 -576884.812500
483.000000 -576899.125000
484.000000 -576912.375000
486.000000 -577030.875000
487.000000 -577089.375000
488.000000 -577242.375000
490.000000 -577269.500000
491.000000 -577302.500000
492.000000 -577316.500000
493.000000 -577338.812500
495.000000 -577434.500000
496.000000 -577493.000000
497.000000 -577622.625000
499.000000 -577651.250000
500.000000 -577684.125000
501.000000 -577700.625000
502.000000 -577730.937500
504.000000 -577806.812500
505.000000 -577860.000000
506.000000 -577957.125000
508.000000 -577989.125000
509.000000 -578017.375000
510.000000 -578046.500000
511.000000 -578065.125000
512.000000 -578082.187500
514.000000 -578173.625000
515.000000 -578252.437500
516.000000 -578369.062500
518.000000 -578396.812500
519.000000 -578429.000000
520.000000 -578447.125000
521.000000 -578471.062500
522.000000 -578474.937500
523.000000 -578480.500000
525.000000 -578618.875000
527.000000 -578674.875000
528.000000 -578729.062500
529.000000 -578735.750000
530.000000 -578801.500000
532.000000 -578843.312500
533.000000 -578862.500000
534.000000 -578908.375000
536.000000 -578949.500000
537.000000 -578984.250000
538.000000 -579035.375000
539.000000 -579035.625000
540.000000 -579095.125000
542.000000 -579144.000000
543.000000 -579158.500000
544.000000 -579215.312500
546.000000 -579256.000000
547.000000 -579277.750000
548.000000 -579324.000000
550.000000 -579361.000000
551.000000 -579393.500000
552.000000 -579435.812500
553.000000 -579446.250000
554.000000 -579490.500000
556.000000 -579540.625000
557.000000 -579565.250000
558.000000 -579626.625000
560.000000 -579660.375000
561.000000 -579684.437500
562.000000 -579718.375000
563.000000 -579730.312500
564.000000 -579761.000000
566.000000 -579824.750000
567.000000 -579863.187500
568.000000 -579948.250000
570.000000 -579976.125000
571.000000 -580002.750000
572.000000 -580025.500000
573.000000 -580046.312500
574.000000 -580057.937500
575.000000 -580065.187500
577.000000 -580170.750000
578.000000 -580217.625000
579.000000 -580354.875000
581.000000 -580376.187500
582.000000 -580403.125000
583.000000 -580412.000000
584.000000 -580432.000000
586.000000 -580515.000000
587.000000 -580547.312500
588.000000 -580660.875000
590.000000 -580683.062500
591.000000 -580711.250000
592.000000 -580722.125000
593.000000 -580744.625000
595.000000 -580813.812500
596.000000 -580859.125000
597.000000 -580947.500000
599.000000 -580973.125000
600.000000 -580997.125000
601.000000 -581018.750000
602.000000 -581034.125000
603.000000 -581045.062500
605.000000 -581127.500000
606.000000 -581201.500000
607.000000 -581307.375000
609.000000 -581330.125000
610.000000 -581355.812500
611.000000 -581369.125000
612.000000 -581389.375000
614.000000 -581454.937500
615.000000 -581505.750000
616.000000 -581593.250000
618.000000 -581616.125000
619.000000 -581642.875000
620.000000 -581659.875000
621.000000 -581681.750000
622.000000 -581684.250000
623.000000 -581696.437500
625.000000 -581794.250000
626.000000 -581796.750000
627.000000 -581923.875000
629.000000 -581942.687500
630.000000 -581963.375000
631.000000 -581974.000000
632.000000 -581983.500000
634.000000 -582068.562500
635.000000 -582115.125000
636.000000 -582232.250000
638.000000 -582249.750000
639.000000 -582279.375000
640.000000 -582283.750000
641.000000 -582309.375000
643.000000 -582371.750000
644.000000 -582391.250000
645.000000 -582471.375000
647.000000 -582496.062500
648.000000 -582514.000000
649.000000 -582535.375000
650.000000 -582544.625000
651.000000 -582558.000000
653.000000 -582635.125000
654.000000 -582665.625000
655.000000 -582765.437500
657.000000 -582785.375000
658.000000 -582807.062500
659.000000 -582820.000000
660.000000 -582834.875000
662.000000 -582900.250000
663.000000 -582960.000000
664.000000 -583050.375000
666.000000 -583069.750000
667.000000 -583096.000000
668.000000 -583107.375000
669.000000 -583130.375000
671.000000 -583180.375000
672.000000 -583212.562500
673.000000 -583275.750000
675.000000 -583299.500000
676.000000 -583319.937500
677.000000 -583341.750000
678.000000 -583354.375000
679.000000 -583369.500000
681.000000 -583429.125000
682.000000 -583476.750000
683.000000 -583552.625000
685.000000 -583574.375000
686.000000 -583596.000000
687.000000 -583611.750000
688.000000 -583626.875000
689.000000 -583632.375000
690.000000 -583634.562500
692.000000 -583729.000000
693.000000 -583748.625000
694.000000 -583878.125000
696.000000 -583889.625000
697.000000 -583916.687500
699.000000 -583954.562500
700.000000 -583985.250000
701.000000 -584033.375000
703.000000 -584055.875000
704.000000 -584076.000000
705.000000 -584099.062500
706.000000 -584111.250000
707.000000 -584133.312500
709.000000 -584177.375000
710.000000 -584216.500000
711.000000 -584274.312500
713.000000 -584295.687500
714.000000 -584315.125000
715.000000 -584332.750000
716.000000 -584348.125000
717.000000 -584361.187500
718.000000 -584362.312500
719.000000 -584365.125000
721.000000 -584462.875000
723.000000 -584499.687500
724.000000 -584535.875000
725.000000 -584538.875000
726.000000 -584581.937500
728.000000 -584611.812500
729.000000 -584624.250000
730.000000 -584659.000000
732.000000 -584686.687500
733.000000 -584706.562500
734.000000 -584736.875000
735.000000 -584737.562500
736.000000 -584770.500000
738.000000 -584809.062500
739.000000 -584820.000000
740.000000 -584868.375000
742.000000 -584892.312500
743.000000 -584908.250000
744.000000 -584931.875000
745.000000 -584937.500000
746.000000 -584958.750000
748.000000 -585009.250000
749.000000 -585027.125000
750.000000 -585094.625000
752.000000 -585113.437500
753.000000 -585131.875000
754.000000 -585144.500000
755.000000 -585156.875000
756.000000 -585163.812500
757.000000 -585164.625000
759.000000 -585251.625000
760.000000 -585267.125000
761.000000 -585380.125000
763.000000 -585392.000000
764.000000 -585411.500000
765.000000 -585414.375000
766.000000 -585427.312500
768.000000 -585493.875000
769.000000 -585499.687500
770.000000 -585589.687500
772.000000 -585605.250000
773.000000 -585624.250000
774.000000 -585630.625000
775.000000 -585643.750000
777.000000 -585700.750000
778.000000 -585725.625000
779.000000 -585798.875000
781.000000 -585815.500000
782.000000 -585833.125000
783.000000 -585845.000000
784.000000 -585857.000000
785.000000 -585858.125000
787.000000 -585927.375000
788.000000 -585979.875000
789.000000 -586067.625000
791.000000 -586082.625000
792.000000 -586103.437500
793.000000 -586107.375000
794.000000 -586122.875000
796.000000 -586173.687500
797.000000 -586192.812500
798.000000 -586261.500000
800.000000 -586277.375000
801.000000 -586295.875000
802.000000 -586306.250000
803.000000 -586319.500000
804.000000 -586319.625000
805.000000 -586322.937500
807.000000 -586406.000000
809.000000 -586434.375000
810.000000 -586465.000000
811.000000 -586468.625000
812.000000 -586504.875000
814.000000 -586530.375000
815.000000 -586541.625000
816.000000 -586571.875000
818.000000 -586595.000000
819.000000 -586611.125000
820.000000 -586636.812500
821.000000 -586638.625000
822.000000 -586666.125000
824.000000 -586699.812500
825.000000 -586710.687500
826.000000 -586754.625000
828.000000 -586774.125000
829.000000 -586786.875000
830.000000 -586806.437500
831.000000 -586811.625000
832.000000 -586828.500000
834.000000 -586872.750000
835.000000 -586891.750000
836.000000 -586949.125000
838.000000 -586965.500000
839.000000 -586980.875000
840.000000 -586994.250000
841.000000 -587005.312500
842.000000 -587008.625000
843.000000 -587011.625000
845.000000 -587085.375000
846.000000 -587096.125000
847.000000 -587192.125000
849.000000 -587202.250000
850.000000 -587218.875000
851.000000 -587221.562500
852.000000 -587233.000000
854.000000 -587290.312500
855.000000 -587299.000000
856.000000 -587376.687500
858.000000 -587389.750000
859.000000 -587406.000000
860.000000 -587411.125000
861.000000 -587423.250000
863.000000 -587472.312500
864.000000 -587492.687500
865.000000 -587554.375000
867.000000 -587569.875000
868.000000 -587584.375000
869.000000 -587594.375000
870.000000 -587604.250000
871.000000 -587607.937500
873.000000 -587666.500000