#topol.top.2#

;
;	File 'topol.top' was generated
;	By user: dhnchandan (1000)
;	On host: dhn-ubuntu
;	At date: Fri Apr 16 19:30:02 2021
;
;	This is a standalone topology file
;
;	Created by:
;	            :-) GROMACS - gmx pdb2gmx, 2020.1-Ubuntu-2020.1-1 (-:
;	
;	Executable:   /usr/bin/gmx
;	Data prefix:  /usr
;	Working dir:  /home/dhnchandan/Notebooks/Bioinformatics/Gromacs/gromacs-experimet
;	Command line:
;	  gmx pdb2gmx -f 1aki_cleaned.pdb -o 1aki_processed.gro -water spce
;	Force field was read from the standard GROMACS share directory.
;

; Include forcefield parameters
#include "oplsaa.ff/forcefield.itp"

[ moleculetype ]
; Name            nrexcl
Protein_chain_A     3

[ atoms ]
;   nr       type  resnr residue  atom   cgnr     charge       mass  typeB    chargeB      massB
; residue   1 LYS rtp LYSH q +2.0
     1   opls_287      1    LYS      N      1       -0.3    14.0027
     2   opls_290      1    LYS     H1      1       0.33      1.008
     3   opls_290      1    LYS     H2      1       0.33      1.008
     4   opls_290      1    LYS     H3      1       0.33      1.008
     5  opls_293B      1    LYS     CA      1       0.25     12.011
     6   opls_140      1    LYS     HA      1       0.06      1.008
     7   opls_136      1    LYS     CB      2      -0.12     12.011
     8   opls_140      1    LYS    HB1      2       0.06      1.008
     9   opls_140      1    LYS    HB2      2       0.06      1.008
    10   opls_136      1    LYS     CG      3      -0.12     12.011
    11   opls_140      1    LYS    HG1      3       0.06      1.008
    12   opls_140      1    LYS    HG2      3       0.06      1.008
    13   opls_136      1    LYS     CD      4      -0.12     12.011
    14   opls_140      1    LYS    HD1      4       0.06      1.008
    15   opls_140      1    LYS    HD2      4       0.06      1.008
    16   opls_292      1    LYS     CE      5       0.19     12.011
    17   opls_140      1    LYS    HE1      5       0.06      1.008
    18   opls_140      1    LYS    HE2      5       0.06      1.008
    19   opls_287      1    LYS     NZ      6       -0.3    14.0067
    20   opls_290      1    LYS    HZ1      6       0.33      1.008
    21   opls_290      1    LYS    HZ2      6       0.33      1.008
    22   opls_290      1    LYS    HZ3      6       0.33      1.008
    23   opls_235      1    LYS      C      7        0.5     12.011
    24   opls_236      1    LYS      O      7       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   2 VAL rtp VAL  q  0.0
    25   opls_238      2    VAL      N      8       -0.5    14.0067
    26   opls_241      2    VAL      H      8        0.3      1.008
    27  opls_224B      2    VAL     CA      8       0.14     12.011
    28   opls_140      2    VAL     HA      8       0.06      1.008
    29   opls_137      2    VAL     CB      9      -0.06     12.011
    30   opls_140      2    VAL     HB      9       0.06      1.008
    31   opls_135      2    VAL    CG1     10      -0.18     12.011
    32   opls_140      2    VAL   HG11     10       0.06      1.008
    33   opls_140      2    VAL   HG12     10       0.06      1.008
    34   opls_140      2    VAL   HG13     10       0.06      1.008
    35   opls_135      2    VAL    CG2     11      -0.18     12.011
    36   opls_140      2    VAL   HG21     11       0.06      1.008
    37   opls_140      2    VAL   HG22     11       0.06      1.008
    38   opls_140      2    VAL   HG23     11       0.06      1.008
    39   opls_235      2    VAL      C     12        0.5     12.011
    40   opls_236      2    VAL      O     12       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   3 PHE rtp PHE  q  0.0
    41   opls_238      3    PHE      N     13       -0.5    14.0067
    42   opls_241      3    PHE      H     13        0.3      1.008
    43  opls_224B      3    PHE     CA     13       0.14     12.011
    44   opls_140      3    PHE     HA     13       0.06      1.008
    45   opls_149      3    PHE     CB     14     -0.005     12.011
    46   opls_140      3    PHE    HB1     14       0.06      1.008
    47   opls_140      3    PHE    HB2     14       0.06      1.008
    48   opls_145      3    PHE     CG     14     -0.115     12.011
    49   opls_145      3    PHE    CD1     15     -0.115     12.011
    50   opls_146      3    PHE    HD1     15      0.115      1.008
    51   opls_145      3    PHE    CD2     16     -0.115     12.011
    52   opls_146      3    PHE    HD2     16      0.115      1.008
    53   opls_145      3    PHE    CE1     17     -0.115     12.011
    54   opls_146      3    PHE    HE1     17      0.115      1.008
    55   opls_145      3    PHE    CE2     18     -0.115     12.011
    56   opls_146      3    PHE    HE2     18      0.115      1.008
    57   opls_145      3    PHE     CZ     19     -0.115     12.011
    58   opls_146      3    PHE     HZ     19      0.115      1.008
    59   opls_235      3    PHE      C     20        0.5     12.011
    60   opls_236      3    PHE      O     20       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   4 GLY rtp GLY  q  0.0
    61   opls_238      4    GLY      N     21       -0.5    14.0067
    62   opls_241      4    GLY      H     21        0.3      1.008
    63  opls_223B      4    GLY     CA     21       0.08     12.011
    64   opls_140      4    GLY    HA1     21       0.06      1.008
    65   opls_140      4    GLY    HA2     21       0.06      1.008
    66   opls_235      4    GLY      C     22        0.5     12.011
    67   opls_236      4    GLY      O     22       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   5 ARG rtp ARG  q +1.0
    68   opls_238      5    ARG      N     23       -0.5    14.0067
    69   opls_241      5    ARG      H     23        0.3      1.008
    70  opls_224B      5    ARG     CA     23       0.14     12.011
    71   opls_140      5    ARG     HA     23       0.06      1.008
    72   opls_136      5    ARG     CB     24      -0.12     12.011
    73   opls_140      5    ARG    HB1     24       0.06      1.008
    74   opls_140      5    ARG    HB2     24       0.06      1.008
    75   opls_308      5    ARG     CG     25      -0.05     12.011
    76   opls_140      5    ARG    HG1     25       0.06      1.008
    77   opls_140      5    ARG    HG2     25       0.06      1.008
    78   opls_307      5    ARG     CD     26       0.19     12.011
    79   opls_140      5    ARG    HD1     26       0.06      1.008
    80   opls_140      5    ARG    HD2     26       0.06      1.008
    81   opls_303      5    ARG     NE     27       -0.7    14.0067
    82   opls_304      5    ARG     HE     27       0.44      1.008
    83   opls_302      5    ARG     CZ     27       0.64     12.011
    84   opls_300      5    ARG    NH1     28       -0.8    14.0067
    85   opls_301      5    ARG   HH11     28       0.46      1.008
    86   opls_301      5    ARG   HH12     28       0.46      1.008
    87   opls_300      5    ARG    NH2     29       -0.8    14.0067
    88   opls_301      5    ARG   HH21     29       0.46      1.008
    89   opls_301      5    ARG   HH22     29       0.46      1.008
    90   opls_235      5    ARG      C     30        0.5     12.011
    91   opls_236      5    ARG      O     30       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue   6 CYS rtp CYS2 q  0.0
    92   opls_238      6    CYS      N     31       -0.5    14.0067
    93   opls_241      6    CYS      H     31        0.3      1.008
    94  opls_224B      6    CYS     CA     31       0.14     12.011
    95   opls_140      6    CYS     HA     31       0.06      1.008
    96   opls_214      6    CYS     CB     32     0.0975     12.011
    97   opls_140      6    CYS    HB1     32       0.06      1.008
    98   opls_140      6    CYS    HB2     32       0.06      1.008
    99   opls_203      6    CYS     SG     32    -0.2175      32.06
   100   opls_235      6    CYS      C     33        0.5     12.011
   101   opls_236      6    CYS      O     33       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue   7 GLU rtp GLU  q -1.0
   102   opls_238      7    GLU      N     34       -0.5    14.0067
   103   opls_241      7    GLU      H     34        0.3      1.008
   104  opls_224B      7    GLU     CA     34       0.14     12.011
   105   opls_140      7    GLU     HA     34       0.06      1.008
   106   opls_136      7    GLU     CB     35      -0.12     12.011
   107   opls_140      7    GLU    HB1     35       0.06      1.008
   108   opls_140      7    GLU    HB2     35       0.06      1.008
   109   opls_274      7    GLU     CG     36      -0.22     12.011
   110   opls_140      7    GLU    HG1     36       0.06      1.008
   111   opls_140      7    GLU    HG2     36       0.06      1.008
   112   opls_271      7    GLU     CD     37        0.7     12.011
   113   opls_272      7    GLU    OE1     37       -0.8    15.9994
   114   opls_272      7    GLU    OE2     37       -0.8    15.9994
   115   opls_235      7    GLU      C     38        0.5     12.011
   116   opls_236      7    GLU      O     38       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   8 LEU rtp LEU  q  0.0
   117   opls_238      8    LEU      N     39       -0.5    14.0067
   118   opls_241      8    LEU      H     39        0.3      1.008
   119  opls_224B      8    LEU     CA     39       0.14     12.011
   120   opls_140      8    LEU     HA     39       0.06      1.008
   121   opls_136      8    LEU     CB     40      -0.12     12.011
   122   opls_140      8    LEU    HB1     40       0.06      1.008
   123   opls_140      8    LEU    HB2     40       0.06      1.008
   124   opls_137      8    LEU     CG     41      -0.06     12.011
   125   opls_140      8    LEU     HG     41       0.06      1.008
   126   opls_135      8    LEU    CD1     42      -0.18     12.011
   127   opls_140      8    LEU   HD11     42       0.06      1.008
   128   opls_140      8    LEU   HD12     42       0.06      1.008
   129   opls_140      8    LEU   HD13     42       0.06      1.008
   130   opls_135      8    LEU    CD2     43      -0.18     12.011
   131   opls_140      8    LEU   HD21     43       0.06      1.008
   132   opls_140      8    LEU   HD22     43       0.06      1.008
   133   opls_140      8    LEU   HD23     43       0.06      1.008
   134   opls_235      8    LEU      C     44        0.5     12.011
   135   opls_236      8    LEU      O     44       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue   9 ALA rtp ALA  q  0.0
   136   opls_238      9    ALA      N     45       -0.5    14.0067
   137   opls_241      9    ALA      H     45        0.3      1.008
   138  opls_224B      9    ALA     CA     45       0.14     12.011
   139   opls_140      9    ALA     HA     45       0.06      1.008
   140   opls_135      9    ALA     CB     46      -0.18     12.011
   141   opls_140      9    ALA    HB1     46       0.06      1.008
   142   opls_140      9    ALA    HB2     46       0.06      1.008
   143   opls_140      9    ALA    HB3     46       0.06      1.008
   144   opls_235      9    ALA      C     47        0.5     12.011
   145   opls_236      9    ALA      O     47       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue  10 ALA rtp ALA  q  0.0
   146   opls_238     10    ALA      N     48       -0.5    14.0067
   147   opls_241     10    ALA      H     48        0.3      1.008
   148  opls_224B     10    ALA     CA     48       0.14     12.011
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   150   opls_135     10    ALA     CB     49      -0.18     12.011
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   152   opls_140     10    ALA    HB2     49       0.06      1.008
   153   opls_140     10    ALA    HB3     49       0.06      1.008
   154   opls_235     10    ALA      C     50        0.5     12.011
   155   opls_236     10    ALA      O     50       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue  11 ALA rtp ALA  q  0.0
   156   opls_238     11    ALA      N     51       -0.5    14.0067
   157   opls_241     11    ALA      H     51        0.3      1.008
   158  opls_224B     11    ALA     CA     51       0.14     12.011
   159   opls_140     11    ALA     HA     51       0.06      1.008
   160   opls_135     11    ALA     CB     52      -0.18     12.011
   161   opls_140     11    ALA    HB1     52       0.06      1.008
   162   opls_140     11    ALA    HB2     52       0.06      1.008
   163   opls_140     11    ALA    HB3     52       0.06      1.008
   164   opls_235     11    ALA      C     53        0.5     12.011
   165   opls_236     11    ALA      O     53       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue  12 MET rtp MET  q  0.0
   166   opls_238     12    MET      N     54       -0.5    14.0067
   167   opls_241     12    MET      H     54        0.3      1.008
   168  opls_224B     12    MET     CA     54       0.14     12.011
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   170   opls_136     12    MET     CB     55      -0.12     12.011
   171   opls_140     12    MET    HB1     55       0.06      1.008
   172   opls_140     12    MET    HB2     55       0.06      1.008
   173   opls_210     12    MET     CG     56      0.048     12.011
   174   opls_140     12    MET    HG1     56       0.06      1.008
   175   opls_140     12    MET    HG2     56       0.06      1.008
   176   opls_202     12    MET     SD     57     -0.335      32.06
   177   opls_209     12    MET     CE     58     -0.013     12.011
   178   opls_140     12    MET    HE1     58       0.06      1.008
   179   opls_140     12    MET    HE2     58       0.06      1.008
   180   opls_140     12    MET    HE3     58       0.06      1.008
   181   opls_235     12    MET      C     59        0.5     12.011
   182   opls_236     12    MET      O     59       -0.5    15.9994   ; qtot 2
; residue  13 LYS rtp LYSH q +1.0
   183   opls_238     13    LYS      N     60       -0.5    14.0067
   184   opls_241     13    LYS      H     60        0.3      1.008
   185  opls_224B     13    LYS     CA     60       0.14     12.011
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   190   opls_136     13    LYS     CG     62      -0.12     12.011
   191   opls_140     13    LYS    HG1     62       0.06      1.008
   192   opls_140     13    LYS    HG2     62       0.06      1.008
   193   opls_136     13    LYS     CD     63      -0.12     12.011
   194   opls_140     13    LYS    HD1     63       0.06      1.008
   195   opls_140     13    LYS    HD2     63       0.06      1.008
   196   opls_292     13    LYS     CE     64       0.19     12.011
   197   opls_140     13    LYS    HE1     64       0.06      1.008
   198   opls_140     13    LYS    HE2     64       0.06      1.008
   199   opls_287     13    LYS     NZ     65       -0.3    14.0067
   200   opls_290     13    LYS    HZ1     65       0.33      1.008
   201   opls_290     13    LYS    HZ2     65       0.33      1.008
   202   opls_290     13    LYS    HZ3     65       0.33      1.008
   203   opls_235     13    LYS      C     66        0.5     12.011
   204   opls_236     13    LYS      O     66       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue  14 ARG rtp ARG  q +1.0
   205   opls_238     14    ARG      N     67       -0.5    14.0067
   206   opls_241     14    ARG      H     67        0.3      1.008
   207  opls_224B     14    ARG     CA     67       0.14     12.011
   208   opls_140     14    ARG     HA     67       0.06      1.008
   209   opls_136     14    ARG     CB     68      -0.12     12.011
   210   opls_140     14    ARG    HB1     68       0.06      1.008
   211   opls_140     14    ARG    HB2     68       0.06      1.008
   212   opls_308     14    ARG     CG     69      -0.05     12.011
   213   opls_140     14    ARG    HG1     69       0.06      1.008
   214   opls_140     14    ARG    HG2     69       0.06      1.008
   215   opls_307     14    ARG     CD     70       0.19     12.011
   216   opls_140     14    ARG    HD1     70       0.06      1.008
   217   opls_140     14    ARG    HD2     70       0.06      1.008
   218   opls_303     14    ARG     NE     71       -0.7    14.0067
   219   opls_304     14    ARG     HE     71       0.44      1.008
   220   opls_302     14    ARG     CZ     71       0.64     12.011
   221   opls_300     14    ARG    NH1     72       -0.8    14.0067
   222   opls_301     14    ARG   HH11     72       0.46      1.008
   223   opls_301     14    ARG   HH12     72       0.46      1.008
   224   opls_300     14    ARG    NH2     73       -0.8    14.0067
   225   opls_301     14    ARG   HH21     73       0.46      1.008
   226   opls_301     14    ARG   HH22     73       0.46      1.008
   227   opls_235     14    ARG      C     74        0.5     12.011
   228   opls_236     14    ARG      O     74       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  15 HIS rtp HISE q  0.0
   229   opls_238     15    HIS      N     75       -0.5    14.0067
   230   opls_241     15    HIS      H     75        0.3      1.008
   231  opls_224B     15    HIS     CA     75       0.14     12.011
   232   opls_140     15    HIS     HA     75       0.06      1.008
   233   opls_505     15    HIS     CB     76     -0.005     12.011
   234   opls_140     15    HIS    HB1     76       0.06      1.008
   235   opls_140     15    HIS    HB2     76       0.06      1.008
   236   opls_507     15    HIS     CG     77     -0.015     12.011
   237   opls_511     15    HIS    ND1     77      -0.49    14.0067
   238   opls_508     15    HIS    CD2     78      0.015     12.011
   239   opls_146     15    HIS    HD2     78      0.115      1.008
   240   opls_506     15    HIS    CE1     79      0.295     12.011
   241   opls_146     15    HIS    HE1     79      0.115      1.008
   242   opls_503     15    HIS    NE2     80      -0.57    14.0067
   243   opls_504     15    HIS    HE2     80       0.42      1.008
   244   opls_235     15    HIS      C     81        0.5     12.011
   245   opls_236     15    HIS      O     81       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  16 GLY rtp GLY  q  0.0
   246   opls_238     16    GLY      N     82       -0.5    14.0067
   247   opls_241     16    GLY      H     82        0.3      1.008
   248  opls_223B     16    GLY     CA     82       0.08     12.011
   249   opls_140     16    GLY    HA1     82       0.06      1.008
   250   opls_140     16    GLY    HA2     82       0.06      1.008
   251   opls_235     16    GLY      C     83        0.5     12.011
   252   opls_236     16    GLY      O     83       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  17 LEU rtp LEU  q  0.0
   253   opls_238     17    LEU      N     84       -0.5    14.0067
   254   opls_241     17    LEU      H     84        0.3      1.008
   255  opls_224B     17    LEU     CA     84       0.14     12.011
   256   opls_140     17    LEU     HA     84       0.06      1.008
   257   opls_136     17    LEU     CB     85      -0.12     12.011
   258   opls_140     17    LEU    HB1     85       0.06      1.008
   259   opls_140     17    LEU    HB2     85       0.06      1.008
   260   opls_137     17    LEU     CG     86      -0.06     12.011
   261   opls_140     17    LEU     HG     86       0.06      1.008
   262   opls_135     17    LEU    CD1     87      -0.18     12.011
   263   opls_140     17    LEU   HD11     87       0.06      1.008
   264   opls_140     17    LEU   HD12     87       0.06      1.008
   265   opls_140     17    LEU   HD13     87       0.06      1.008
   266   opls_135     17    LEU    CD2     88      -0.18     12.011
   267   opls_140     17    LEU   HD21     88       0.06      1.008
   268   opls_140     17    LEU   HD22     88       0.06      1.008
   269   opls_140     17    LEU   HD23     88       0.06      1.008
   270   opls_235     17    LEU      C     89        0.5     12.011
   271   opls_236     17    LEU      O     89       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  18 ASP rtp ASP  q -1.0
   272   opls_238     18    ASP      N     90       -0.5    14.0067
   273   opls_241     18    ASP      H     90        0.3      1.008
   274  opls_224B     18    ASP     CA     90       0.14     12.011
   275   opls_140     18    ASP     HA     90       0.06      1.008
   276   opls_274     18    ASP     CB     91      -0.22     12.011
   277   opls_140     18    ASP    HB1     91       0.06      1.008
   278   opls_140     18    ASP    HB2     91       0.06      1.008
   279   opls_271     18    ASP     CG     92        0.7     12.011
   280   opls_272     18    ASP    OD1     92       -0.8    15.9994
   281   opls_272     18    ASP    OD2     92       -0.8    15.9994
   282   opls_235     18    ASP      C     93        0.5     12.011
   283   opls_236     18    ASP      O     93       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue  19 ASN rtp ASN  q  0.0
   284   opls_238     19    ASN      N     94       -0.5    14.0067
   285   opls_241     19    ASN      H     94        0.3      1.008
   286  opls_224B     19    ASN     CA     95       0.14     12.011
   287   opls_140     19    ASN     HA     95       0.06      1.008
   288   opls_136     19    ASN     CB     96      -0.12     12.011
   289   opls_140     19    ASN    HB1     96       0.06      1.008
   290   opls_140     19    ASN    HB2     96       0.06      1.008
   291   opls_235     19    ASN     CG     97        0.5     12.011
   292   opls_236     19    ASN    OD1     97       -0.5    15.9994
   293   opls_237     19    ASN    ND2     98      -0.76    14.0067
   294   opls_240     19    ASN   HD21     98       0.38      1.008
   295   opls_240     19    ASN   HD22     98       0.38      1.008
   296   opls_235     19    ASN      C     99        0.5     12.011
   297   opls_236     19    ASN      O     99       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue  20 TYR rtp TYR  q  0.0
   298   opls_238     20    TYR      N    100       -0.5    14.0067
   299   opls_241     20    TYR      H    100        0.3      1.008
   300  opls_224B     20    TYR     CA    100       0.14     12.011
   301   opls_140     20    TYR     HA    100       0.06      1.008
   302   opls_149     20    TYR     CB    101     -0.005     12.011
   303   opls_140     20    TYR    HB1    101       0.06      1.008
   304   opls_140     20    TYR    HB2    101       0.06      1.008
   305   opls_145     20    TYR     CG    101     -0.115     12.011
   306   opls_145     20    TYR    CD1    102     -0.115     12.011
   307   opls_146     20    TYR    HD1    102      0.115      1.008
   308   opls_145     20    TYR    CD2    103     -0.115     12.011
   309   opls_146     20    TYR    HD2    103      0.115      1.008
   310   opls_145     20    TYR    CE1    104     -0.115     12.011
   311   opls_146     20    TYR    HE1    104      0.115      1.008
   312   opls_145     20    TYR    CE2    105     -0.115     12.011
   313   opls_146     20    TYR    HE2    105      0.115      1.008
   314   opls_166     20    TYR     CZ    106       0.15     12.011
   315   opls_167     20    TYR     OH    106     -0.585    15.9994
   316   opls_168     20    TYR     HH    106      0.435      1.008
   317   opls_235     20    TYR      C    107        0.5     12.011
   318   opls_236     20    TYR      O    107       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue  21 ARG rtp ARG  q +1.0
   319   opls_238     21    ARG      N    108       -0.5    14.0067
   320   opls_241     21    ARG      H    108        0.3      1.008
   321  opls_224B     21    ARG     CA    108       0.14     12.011
   322   opls_140     21    ARG     HA    108       0.06      1.008
   323   opls_136     21    ARG     CB    109      -0.12     12.011
   324   opls_140     21    ARG    HB1    109       0.06      1.008
   325   opls_140     21    ARG    HB2    109       0.06      1.008
   326   opls_308     21    ARG     CG    110      -0.05     12.011
   327   opls_140     21    ARG    HG1    110       0.06      1.008
   328   opls_140     21    ARG    HG2    110       0.06      1.008
   329   opls_307     21    ARG     CD    111       0.19     12.011
   330   opls_140     21    ARG    HD1    111       0.06      1.008
   331   opls_140     21    ARG    HD2    111       0.06      1.008
   332   opls_303     21    ARG     NE    112       -0.7    14.0067
   333   opls_304     21    ARG     HE    112       0.44      1.008
   334   opls_302     21    ARG     CZ    112       0.64     12.011
   335   opls_300     21    ARG    NH1    113       -0.8    14.0067
   336   opls_301     21    ARG   HH11    113       0.46      1.008
   337   opls_301     21    ARG   HH12    113       0.46      1.008
   338   opls_300     21    ARG    NH2    114       -0.8    14.0067
   339   opls_301     21    ARG   HH21    114       0.46      1.008
   340   opls_301     21    ARG   HH22    114       0.46      1.008
   341   opls_235     21    ARG      C    115        0.5     12.011
   342   opls_236     21    ARG      O    115       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  22 GLY rtp GLY  q  0.0
   343   opls_238     22    GLY      N    116       -0.5    14.0067
   344   opls_241     22    GLY      H    116        0.3      1.008
   345  opls_223B     22    GLY     CA    116       0.08     12.011
   346   opls_140     22    GLY    HA1    116       0.06      1.008
   347   opls_140     22    GLY    HA2    116       0.06      1.008
   348   opls_235     22    GLY      C    117        0.5     12.011
   349   opls_236     22    GLY      O    117       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  23 TYR rtp TYR  q  0.0
   350   opls_238     23    TYR      N    118       -0.5    14.0067
   351   opls_241     23    TYR      H    118        0.3      1.008
   352  opls_224B     23    TYR     CA    118       0.14     12.011
   353   opls_140     23    TYR     HA    118       0.06      1.008
   354   opls_149     23    TYR     CB    119     -0.005     12.011
   355   opls_140     23    TYR    HB1    119       0.06      1.008
   356   opls_140     23    TYR    HB2    119       0.06      1.008
   357   opls_145     23    TYR     CG    119     -0.115     12.011
   358   opls_145     23    TYR    CD1    120     -0.115     12.011
   359   opls_146     23    TYR    HD1    120      0.115      1.008
   360   opls_145     23    TYR    CD2    121     -0.115     12.011
   361   opls_146     23    TYR    HD2    121      0.115      1.008
   362   opls_145     23    TYR    CE1    122     -0.115     12.011
   363   opls_146     23    TYR    HE1    122      0.115      1.008
   364   opls_145     23    TYR    CE2    123     -0.115     12.011
   365   opls_146     23    TYR    HE2    123      0.115      1.008
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   367   opls_167     23    TYR     OH    124     -0.585    15.9994
   368   opls_168     23    TYR     HH    124      0.435      1.008
   369   opls_235     23    TYR      C    125        0.5     12.011
   370   opls_236     23    TYR      O    125       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  24 SER rtp SER  q  0.0
   371   opls_238     24    SER      N    126       -0.5    14.0067
   372   opls_241     24    SER      H    126        0.3      1.008
   373  opls_224B     24    SER     CA    126       0.14     12.011
   374   opls_140     24    SER     HA    126       0.06      1.008
   375   opls_157     24    SER     CB    127      0.145     12.011
   376   opls_140     24    SER    HB1    127       0.06      1.008
   377   opls_140     24    SER    HB2    127       0.06      1.008
   378   opls_154     24    SER     OG    128     -0.683    15.9994
   379   opls_155     24    SER     HG    128      0.418      1.008
   380   opls_235     24    SER      C    129        0.5     12.011
   381   opls_236     24    SER      O    129       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  25 LEU rtp LEU  q  0.0
   382   opls_238     25    LEU      N    130       -0.5    14.0067
   383   opls_241     25    LEU      H    130        0.3      1.008
   384  opls_224B     25    LEU     CA    130       0.14     12.011
   385   opls_140     25    LEU     HA    130       0.06      1.008
   386   opls_136     25    LEU     CB    131      -0.12     12.011
   387   opls_140     25    LEU    HB1    131       0.06      1.008
   388   opls_140     25    LEU    HB2    131       0.06      1.008
   389   opls_137     25    LEU     CG    132      -0.06     12.011
   390   opls_140     25    LEU     HG    132       0.06      1.008
   391   opls_135     25    LEU    CD1    133      -0.18     12.011
   392   opls_140     25    LEU   HD11    133       0.06      1.008
   393   opls_140     25    LEU   HD12    133       0.06      1.008
   394   opls_140     25    LEU   HD13    133       0.06      1.008
   395   opls_135     25    LEU    CD2    134      -0.18     12.011
   396   opls_140     25    LEU   HD21    134       0.06      1.008
   397   opls_140     25    LEU   HD22    134       0.06      1.008
   398   opls_140     25    LEU   HD23    134       0.06      1.008
   399   opls_235     25    LEU      C    135        0.5     12.011
   400   opls_236     25    LEU      O    135       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  26 GLY rtp GLY  q  0.0
   401   opls_238     26    GLY      N    136       -0.5    14.0067
   402   opls_241     26    GLY      H    136        0.3      1.008
   403  opls_223B     26    GLY     CA    136       0.08     12.011
   404   opls_140     26    GLY    HA1    136       0.06      1.008
   405   opls_140     26    GLY    HA2    136       0.06      1.008
   406   opls_235     26    GLY      C    137        0.5     12.011
   407   opls_236     26    GLY      O    137       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  27 ASN rtp ASN  q  0.0
   408   opls_238     27    ASN      N    138       -0.5    14.0067
   409   opls_241     27    ASN      H    138        0.3      1.008
   410  opls_224B     27    ASN     CA    139       0.14     12.011
   411   opls_140     27    ASN     HA    139       0.06      1.008
   412   opls_136     27    ASN     CB    140      -0.12     12.011
   413   opls_140     27    ASN    HB1    140       0.06      1.008
   414   opls_140     27    ASN    HB2    140       0.06      1.008
   415   opls_235     27    ASN     CG    141        0.5     12.011
   416   opls_236     27    ASN    OD1    141       -0.5    15.9994
   417   opls_237     27    ASN    ND2    142      -0.76    14.0067
   418   opls_240     27    ASN   HD21    142       0.38      1.008
   419   opls_240     27    ASN   HD22    142       0.38      1.008
   420   opls_235     27    ASN      C    143        0.5     12.011
   421   opls_236     27    ASN      O    143       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  28 TRP rtp TRP  q  0.0
   422   opls_238     28    TRP      N    144       -0.5    14.0067
   423   opls_241     28    TRP      H    144        0.3      1.008
   424  opls_224B     28    TRP     CA    144       0.14     12.011
   425   opls_140     28    TRP     HA    144       0.06      1.008
   426   opls_136     28    TRP     CB    145      -0.12     12.011
   427   opls_140     28    TRP    HB1    145       0.06      1.008
   428   opls_140     28    TRP    HB2    145       0.06      1.008
   429   opls_500     28    TRP     CG    146      0.075     12.011
   430   opls_514     28    TRP    CD1    147     -0.115     12.011
   431   opls_146     28    TRP    HD1    147      0.115      1.008
   432   opls_501     28    TRP    CD2    148     -0.055     12.011
   433   opls_503     28    TRP    NE1    149      -0.57    14.0067
   434   opls_504     28    TRP    HE1    149       0.42      1.008
   435   opls_502     28    TRP    CE2    149       0.13     12.011
   436   opls_145     28    TRP    CE3    150     -0.115     12.011
   437   opls_146     28    TRP    HE3    150      0.115      1.008
   438   opls_145     28    TRP    CZ2    151     -0.115     12.011
   439   opls_146     28    TRP    HZ2    151      0.115      1.008
   440   opls_145     28    TRP    CZ3    152     -0.115     12.011
   441   opls_146     28    TRP    HZ3    152      0.115      1.008
   442   opls_145     28    TRP    CH2    153     -0.115     12.011
   443   opls_146     28    TRP    HH2    153      0.115      1.008
   444   opls_235     28    TRP      C    154        0.5     12.011
   445   opls_236     28    TRP      O    154       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  29 VAL rtp VAL  q  0.0
   446   opls_238     29    VAL      N    155       -0.5    14.0067
   447   opls_241     29    VAL      H    155        0.3      1.008
   448  opls_224B     29    VAL     CA    155       0.14     12.011
   449   opls_140     29    VAL     HA    155       0.06      1.008
   450   opls_137     29    VAL     CB    156      -0.06     12.011
   451   opls_140     29    VAL     HB    156       0.06      1.008
   452   opls_135     29    VAL    CG1    157      -0.18     12.011
   453   opls_140     29    VAL   HG11    157       0.06      1.008
   454   opls_140     29    VAL   HG12    157       0.06      1.008
   455   opls_140     29    VAL   HG13    157       0.06      1.008
   456   opls_135     29    VAL    CG2    158      -0.18     12.011
   457   opls_140     29    VAL   HG21    158       0.06      1.008
   458   opls_140     29    VAL   HG22    158       0.06      1.008
   459   opls_140     29    VAL   HG23    158       0.06      1.008
   460   opls_235     29    VAL      C    159        0.5     12.011
   461   opls_236     29    VAL      O    159       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  30 CYS rtp CYS2 q  0.0
   462   opls_238     30    CYS      N    160       -0.5    14.0067
   463   opls_241     30    CYS      H    160        0.3      1.008
   464  opls_224B     30    CYS     CA    160       0.14     12.011
   465   opls_140     30    CYS     HA    160       0.06      1.008
   466   opls_214     30    CYS     CB    161     0.0975     12.011
   467   opls_140     30    CYS    HB1    161       0.06      1.008
   468   opls_140     30    CYS    HB2    161       0.06      1.008
   469   opls_203     30    CYS     SG    161    -0.2175      32.06
   470   opls_235     30    CYS      C    162        0.5     12.011
   471   opls_236     30    CYS      O    162       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  31 ALA rtp ALA  q  0.0
   472   opls_238     31    ALA      N    163       -0.5    14.0067
   473   opls_241     31    ALA      H    163        0.3      1.008
   474  opls_224B     31    ALA     CA    163       0.14     12.011
   475   opls_140     31    ALA     HA    163       0.06      1.008
   476   opls_135     31    ALA     CB    164      -0.18     12.011
   477   opls_140     31    ALA    HB1    164       0.06      1.008
   478   opls_140     31    ALA    HB2    164       0.06      1.008
   479   opls_140     31    ALA    HB3    164       0.06      1.008
   480   opls_235     31    ALA      C    165        0.5     12.011
   481   opls_236     31    ALA      O    165       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  32 ALA rtp ALA  q  0.0
   482   opls_238     32    ALA      N    166       -0.5    14.0067
   483   opls_241     32    ALA      H    166        0.3      1.008
   484  opls_224B     32    ALA     CA    166       0.14     12.011
   485   opls_140     32    ALA     HA    166       0.06      1.008
   486   opls_135     32    ALA     CB    167      -0.18     12.011
   487   opls_140     32    ALA    HB1    167       0.06      1.008
   488   opls_140     32    ALA    HB2    167       0.06      1.008
   489   opls_140     32    ALA    HB3    167       0.06      1.008
   490   opls_235     32    ALA      C    168        0.5     12.011
   491   opls_236     32    ALA      O    168       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  33 LYS rtp LYSH q +1.0
   492   opls_238     33    LYS      N    169       -0.5    14.0067
   493   opls_241     33    LYS      H    169        0.3      1.008
   494  opls_224B     33    LYS     CA    169       0.14     12.011
   495   opls_140     33    LYS     HA    169       0.06      1.008
   496   opls_136     33    LYS     CB    170      -0.12     12.011
   497   opls_140     33    LYS    HB1    170       0.06      1.008
   498   opls_140     33    LYS    HB2    170       0.06      1.008
   499   opls_136     33    LYS     CG    171      -0.12     12.011
   500   opls_140     33    LYS    HG1    171       0.06      1.008
   501   opls_140     33    LYS    HG2    171       0.06      1.008
   502   opls_136     33    LYS     CD    172      -0.12     12.011
   503   opls_140     33    LYS    HD1    172       0.06      1.008
   504   opls_140     33    LYS    HD2    172       0.06      1.008
   505   opls_292     33    LYS     CE    173       0.19     12.011
   506   opls_140     33    LYS    HE1    173       0.06      1.008
   507   opls_140     33    LYS    HE2    173       0.06      1.008
   508   opls_287     33    LYS     NZ    174       -0.3    14.0067
   509   opls_290     33    LYS    HZ1    174       0.33      1.008
   510   opls_290     33    LYS    HZ2    174       0.33      1.008
   511   opls_290     33    LYS    HZ3    174       0.33      1.008
   512   opls_235     33    LYS      C    175        0.5     12.011
   513   opls_236     33    LYS      O    175       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  34 PHE rtp PHE  q  0.0
   514   opls_238     34    PHE      N    176       -0.5    14.0067
   515   opls_241     34    PHE      H    176        0.3      1.008
   516  opls_224B     34    PHE     CA    176       0.14     12.011
   517   opls_140     34    PHE     HA    176       0.06      1.008
   518   opls_149     34    PHE     CB    177     -0.005     12.011
   519   opls_140     34    PHE    HB1    177       0.06      1.008
   520   opls_140     34    PHE    HB2    177       0.06      1.008
   521   opls_145     34    PHE     CG    177     -0.115     12.011
   522   opls_145     34    PHE    CD1    178     -0.115     12.011
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   524   opls_145     34    PHE    CD2    179     -0.115     12.011
   525   opls_146     34    PHE    HD2    179      0.115      1.008
   526   opls_145     34    PHE    CE1    180     -0.115     12.011
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   529   opls_146     34    PHE    HE2    181      0.115      1.008
   530   opls_145     34    PHE     CZ    182     -0.115     12.011
   531   opls_146     34    PHE     HZ    182      0.115      1.008
   532   opls_235     34    PHE      C    183        0.5     12.011
   533   opls_236     34    PHE      O    183       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  35 GLU rtp GLU  q -1.0
   534   opls_238     35    GLU      N    184       -0.5    14.0067
   535   opls_241     35    GLU      H    184        0.3      1.008
   536  opls_224B     35    GLU     CA    184       0.14     12.011
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   539   opls_140     35    GLU    HB1    185       0.06      1.008
   540   opls_140     35    GLU    HB2    185       0.06      1.008
   541   opls_274     35    GLU     CG    186      -0.22     12.011
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   543   opls_140     35    GLU    HG2    186       0.06      1.008
   544   opls_271     35    GLU     CD    187        0.7     12.011
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   546   opls_272     35    GLU    OE2    187       -0.8    15.9994
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   548   opls_236     35    GLU      O    188       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  36 SER rtp SER  q  0.0
   549   opls_238     36    SER      N    189       -0.5    14.0067
   550   opls_241     36    SER      H    189        0.3      1.008
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   555   opls_140     36    SER    HB2    190       0.06      1.008
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   557   opls_155     36    SER     HG    191      0.418      1.008
   558   opls_235     36    SER      C    192        0.5     12.011
   559   opls_236     36    SER      O    192       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  37 ASN rtp ASN  q  0.0
   560   opls_238     37    ASN      N    193       -0.5    14.0067
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   564   opls_136     37    ASN     CB    195      -0.12     12.011
   565   opls_140     37    ASN    HB1    195       0.06      1.008
   566   opls_140     37    ASN    HB2    195       0.06      1.008
   567   opls_235     37    ASN     CG    196        0.5     12.011
   568   opls_236     37    ASN    OD1    196       -0.5    15.9994
   569   opls_237     37    ASN    ND2    197      -0.76    14.0067
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   572   opls_235     37    ASN      C    198        0.5     12.011
   573   opls_236     37    ASN      O    198       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  38 PHE rtp PHE  q  0.0
   574   opls_238     38    PHE      N    199       -0.5    14.0067
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   590   opls_145     38    PHE     CZ    205     -0.115     12.011
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   593   opls_236     38    PHE      O    206       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  39 ASN rtp ASN  q  0.0
   594   opls_238     39    ASN      N    207       -0.5    14.0067
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   601   opls_235     39    ASN     CG    210        0.5     12.011
   602   opls_236     39    ASN    OD1    210       -0.5    15.9994
   603   opls_237     39    ASN    ND2    211      -0.76    14.0067
   604   opls_240     39    ASN   HD21    211       0.38      1.008
   605   opls_240     39    ASN   HD22    211       0.38      1.008
   606   opls_235     39    ASN      C    212        0.5     12.011
   607   opls_236     39    ASN      O    212       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  40 THR rtp THR  q  0.0
   608   opls_238     40    THR      N    213       -0.5    14.0067
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   615   opls_155     40    THR    HG1    214      0.418      1.008
   616   opls_135     40    THR    CG2    215      -0.18     12.011
   617   opls_140     40    THR   HG21    215       0.06      1.008
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   619   opls_140     40    THR   HG23    215       0.06      1.008
   620   opls_235     40    THR      C    216        0.5     12.011
   621   opls_236     40    THR      O    216       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  41 GLN rtp GLN  q  0.0
   622   opls_238     41    GLN      N    217       -0.5    14.0067
   623   opls_241     41    GLN      H    217        0.3      1.008
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   627   opls_140     41    GLN    HB1    219       0.06      1.008
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   629   opls_136     41    GLN     CG    220      -0.12     12.011
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   631   opls_140     41    GLN    HG2    220       0.06      1.008
   632   opls_235     41    GLN     CD    221        0.5     12.011
   633   opls_236     41    GLN    OE1    221       -0.5    15.9994
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   636   opls_240     41    GLN   HE22    222       0.38      1.008
   637   opls_235     41    GLN      C    223        0.5     12.011
   638   opls_236     41    GLN      O    223       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  42 ALA rtp ALA  q  0.0
   639   opls_238     42    ALA      N    224       -0.5    14.0067
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; residue  43 THR rtp THR  q  0.0
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; residue  44 ASN rtp ASN  q  0.0
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; residue  45 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue  46 ASN rtp ASN  q  0.0
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; residue  47 THR rtp THR  q  0.0
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; residue  48 ASP rtp ASP  q -1.0
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; residue  49 GLY rtp GLY  q  0.0
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; residue  50 SER rtp SER  q  0.0
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; residue  51 THR rtp THR  q  0.0
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   772   opls_236     51    THR      O    268       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  52 ASP rtp ASP  q -1.0
   773   opls_238     52    ASP      N    269       -0.5    14.0067
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; residue  53 TYR rtp TYR  q  0.0
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; residue  54 GLY rtp GLY  q  0.0
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; residue  55 ILE rtp ILE  q  0.0
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; residue  56 LEU rtp LEU  q  0.0
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; residue  57 GLN rtp GLN  q  0.0
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; residue  58 ILE rtp ILE  q  0.0
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; residue  59 ASN rtp ASN  q  0.0
   887   opls_238     59    ASN      N    308       -0.5    14.0067
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   900   opls_236     59    ASN      O    313       -0.5    15.9994   ; qtot 3
; residue  60 SER rtp SER  q  0.0
   901   opls_238     60    SER      N    314       -0.5    14.0067
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; residue  61 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue  62 TRP rtp TRP  q  0.0
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; residue  63 TRP rtp TRP  q  0.0
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; residue  64 CYS rtp CYS2 q  0.0
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; residue  65 ASN rtp ASN  q  0.0
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; residue  66 ASP rtp ASP  q -1.0
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; residue  68 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue  70 PRO rtp PRO  q  0.0
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; residue  71 GLY rtp GLY  q  0.0
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; residue  72 SER rtp SER  q  0.0
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; residue  73 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue  74 ASN rtp ASN  q  0.0
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; residue  75 LEU rtp LEU  q  0.0
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  1143   opls_140     75    LEU     HG    402       0.06      1.008
  1144   opls_135     75    LEU    CD1    403      -0.18     12.011
  1145   opls_140     75    LEU   HD11    403       0.06      1.008
  1146   opls_140     75    LEU   HD12    403       0.06      1.008
  1147   opls_140     75    LEU   HD13    403       0.06      1.008
  1148   opls_135     75    LEU    CD2    404      -0.18     12.011
  1149   opls_140     75    LEU   HD21    404       0.06      1.008
  1150   opls_140     75    LEU   HD22    404       0.06      1.008
  1151   opls_140     75    LEU   HD23    404       0.06      1.008
  1152   opls_235     75    LEU      C    405        0.5     12.011
  1153   opls_236     75    LEU      O    405       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  76 CYS rtp CYS2 q  0.0
  1154   opls_238     76    CYS      N    406       -0.5    14.0067
  1155   opls_241     76    CYS      H    406        0.3      1.008
  1156  opls_224B     76    CYS     CA    406       0.14     12.011
  1157   opls_140     76    CYS     HA    406       0.06      1.008
  1158   opls_214     76    CYS     CB    407     0.0975     12.011
  1159   opls_140     76    CYS    HB1    407       0.06      1.008
  1160   opls_140     76    CYS    HB2    407       0.06      1.008
  1161   opls_203     76    CYS     SG    407    -0.2175      32.06
  1162   opls_235     76    CYS      C    408        0.5     12.011
  1163   opls_236     76    CYS      O    408       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  77 ASN rtp ASN  q  0.0
  1164   opls_238     77    ASN      N    409       -0.5    14.0067
  1165   opls_241     77    ASN      H    409        0.3      1.008
  1166  opls_224B     77    ASN     CA    410       0.14     12.011
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  1168   opls_136     77    ASN     CB    411      -0.12     12.011
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  1170   opls_140     77    ASN    HB2    411       0.06      1.008
  1171   opls_235     77    ASN     CG    412        0.5     12.011
  1172   opls_236     77    ASN    OD1    412       -0.5    15.9994
  1173   opls_237     77    ASN    ND2    413      -0.76    14.0067
  1174   opls_240     77    ASN   HD21    413       0.38      1.008
  1175   opls_240     77    ASN   HD22    413       0.38      1.008
  1176   opls_235     77    ASN      C    414        0.5     12.011
  1177   opls_236     77    ASN      O    414       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  78 ILE rtp ILE  q  0.0
  1178   opls_238     78    ILE      N    415       -0.5    14.0067
  1179   opls_241     78    ILE      H    415        0.3      1.008
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  1181   opls_140     78    ILE     HA    415       0.06      1.008
  1182   opls_137     78    ILE     CB    416      -0.06     12.011
  1183   opls_140     78    ILE     HB    416       0.06      1.008
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  1185   opls_140     78    ILE   HG11    417       0.06      1.008
  1186   opls_140     78    ILE   HG12    417       0.06      1.008
  1187   opls_135     78    ILE    CG2    418      -0.18     12.011
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  1196   opls_236     78    ILE      O    420       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  79 PRO rtp PRO  q  0.0
  1197   opls_239     79    PRO      N    421      -0.14    14.0067
  1198   opls_246     79    PRO     CA    421       0.01     12.011
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  1202   opls_140     79    PRO    HB2    422       0.06      1.008
  1203   opls_136     79    PRO     CG    423      -0.12     12.011
  1204   opls_140     79    PRO    HG1    423       0.06      1.008
  1205   opls_140     79    PRO    HG2    423       0.06      1.008
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  1210   opls_236     79    PRO      O    425       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  80 CYS rtp CYS2 q  0.0
  1211   opls_238     80    CYS      N    426       -0.5    14.0067
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  1218   opls_203     80    CYS     SG    427    -0.2175      32.06
  1219   opls_235     80    CYS      C    428        0.5     12.011
  1220   opls_236     80    CYS      O    428       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  81 SER rtp SER  q  0.0
  1221   opls_238     81    SER      N    429       -0.5    14.0067
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  1223  opls_224B     81    SER     CA    429       0.14     12.011
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  1225   opls_157     81    SER     CB    430      0.145     12.011
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  1229   opls_155     81    SER     HG    431      0.418      1.008
  1230   opls_235     81    SER      C    432        0.5     12.011
  1231   opls_236     81    SER      O    432       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  82 ALA rtp ALA  q  0.0
  1232   opls_238     82    ALA      N    433       -0.5    14.0067
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  1239   opls_140     82    ALA    HB3    434       0.06      1.008
  1240   opls_235     82    ALA      C    435        0.5     12.011
  1241   opls_236     82    ALA      O    435       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  83 LEU rtp LEU  q  0.0
  1242   opls_238     83    LEU      N    436       -0.5    14.0067
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  1251   opls_135     83    LEU    CD1    439      -0.18     12.011
  1252   opls_140     83    LEU   HD11    439       0.06      1.008
  1253   opls_140     83    LEU   HD12    439       0.06      1.008
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  1260   opls_236     83    LEU      O    441       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  84 LEU rtp LEU  q  0.0
  1261   opls_238     84    LEU      N    442       -0.5    14.0067
  1262   opls_241     84    LEU      H    442        0.3      1.008
  1263  opls_224B     84    LEU     CA    442       0.14     12.011
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  1265   opls_136     84    LEU     CB    443      -0.12     12.011
  1266   opls_140     84    LEU    HB1    443       0.06      1.008
  1267   opls_140     84    LEU    HB2    443       0.06      1.008
  1268   opls_137     84    LEU     CG    444      -0.06     12.011
  1269   opls_140     84    LEU     HG    444       0.06      1.008
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; residue  85 SER rtp SER  q  0.0
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; residue  91 SER rtp SER  q  0.0
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; residue  94 CYS rtp CYS2 q  0.0
  1398   opls_238     94    CYS      N    488       -0.5    14.0067
  1399   opls_241     94    CYS      H    488        0.3      1.008
  1400  opls_224B     94    CYS     CA    488       0.14     12.011
  1401   opls_140     94    CYS     HA    488       0.06      1.008
  1402   opls_214     94    CYS     CB    489     0.0975     12.011
  1403   opls_140     94    CYS    HB1    489       0.06      1.008
  1404   opls_140     94    CYS    HB2    489       0.06      1.008
  1405   opls_203     94    CYS     SG    489    -0.2175      32.06
  1406   opls_235     94    CYS      C    490        0.5     12.011
  1407   opls_236     94    CYS      O    490       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  95 ALA rtp ALA  q  0.0
  1408   opls_238     95    ALA      N    491       -0.5    14.0067
  1409   opls_241     95    ALA      H    491        0.3      1.008
  1410  opls_224B     95    ALA     CA    491       0.14     12.011
  1411   opls_140     95    ALA     HA    491       0.06      1.008
  1412   opls_135     95    ALA     CB    492      -0.18     12.011
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  1416   opls_235     95    ALA      C    493        0.5     12.011
  1417   opls_236     95    ALA      O    493       -0.5    15.9994   ; qtot 4
; residue  96 LYS rtp LYSH q +1.0
  1418   opls_238     96    LYS      N    494       -0.5    14.0067
  1419   opls_241     96    LYS      H    494        0.3      1.008
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  1438   opls_235     96    LYS      C    500        0.5     12.011
  1439   opls_236     96    LYS      O    500       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue  97 LYS rtp LYSH q +1.0
  1440   opls_238     97    LYS      N    501       -0.5    14.0067
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  1452   opls_140     97    LYS    HD2    504       0.06      1.008
  1453   opls_292     97    LYS     CE    505       0.19     12.011
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  1455   opls_140     97    LYS    HE2    505       0.06      1.008
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; residue  98 ILE rtp ILE  q  0.0
  1462   opls_238     98    ILE      N    508       -0.5    14.0067
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  1475   opls_135     98    ILE     CD    512      -0.18     12.011
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  1479   opls_235     98    ILE      C    513        0.5     12.011
  1480   opls_236     98    ILE      O    513       -0.5    15.9994   ; qtot 6
; residue  99 VAL rtp VAL  q  0.0
  1481   opls_238     99    VAL      N    514       -0.5    14.0067
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; residue 100 SER rtp SER  q  0.0
  1497   opls_238    100    SER      N    519       -0.5    14.0067
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  1506   opls_235    100    SER      C    522        0.5     12.011
  1507   opls_236    100    SER      O    522       -0.5    15.9994   ; qtot 6
; residue 101 ASP rtp ASP  q -1.0
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  1510  opls_224B    101    ASP     CA    523       0.14     12.011
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  1515   opls_271    101    ASP     CG    525        0.7     12.011
  1516   opls_272    101    ASP    OD1    525       -0.8    15.9994
  1517   opls_272    101    ASP    OD2    525       -0.8    15.9994
  1518   opls_235    101    ASP      C    526        0.5     12.011
  1519   opls_236    101    ASP      O    526       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 102 GLY rtp GLY  q  0.0
  1520   opls_238    102    GLY      N    527       -0.5    14.0067
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  1524   opls_140    102    GLY    HA2    527       0.06      1.008
  1525   opls_235    102    GLY      C    528        0.5     12.011
  1526   opls_236    102    GLY      O    528       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 103 ASN rtp ASN  q  0.0
  1527   opls_238    103    ASN      N    529       -0.5    14.0067
  1528   opls_241    103    ASN      H    529        0.3      1.008
  1529  opls_224B    103    ASN     CA    530       0.14     12.011
  1530   opls_140    103    ASN     HA    530       0.06      1.008
  1531   opls_136    103    ASN     CB    531      -0.12     12.011
  1532   opls_140    103    ASN    HB1    531       0.06      1.008
  1533   opls_140    103    ASN    HB2    531       0.06      1.008
  1534   opls_235    103    ASN     CG    532        0.5     12.011
  1535   opls_236    103    ASN    OD1    532       -0.5    15.9994
  1536   opls_237    103    ASN    ND2    533      -0.76    14.0067
  1537   opls_240    103    ASN   HD21    533       0.38      1.008
  1538   opls_240    103    ASN   HD22    533       0.38      1.008
  1539   opls_235    103    ASN      C    534        0.5     12.011
  1540   opls_236    103    ASN      O    534       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 104 GLY rtp GLY  q  0.0
  1541   opls_238    104    GLY      N    535       -0.5    14.0067
  1542   opls_241    104    GLY      H    535        0.3      1.008
  1543  opls_223B    104    GLY     CA    535       0.08     12.011
  1544   opls_140    104    GLY    HA1    535       0.06      1.008
  1545   opls_140    104    GLY    HA2    535       0.06      1.008
  1546   opls_235    104    GLY      C    536        0.5     12.011
  1547   opls_236    104    GLY      O    536       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 105 MET rtp MET  q  0.0
  1548   opls_238    105    MET      N    537       -0.5    14.0067
  1549   opls_241    105    MET      H    537        0.3      1.008
  1550  opls_224B    105    MET     CA    537       0.14     12.011
  1551   opls_140    105    MET     HA    537       0.06      1.008
  1552   opls_136    105    MET     CB    538      -0.12     12.011
  1553   opls_140    105    MET    HB1    538       0.06      1.008
  1554   opls_140    105    MET    HB2    538       0.06      1.008
  1555   opls_210    105    MET     CG    539      0.048     12.011
  1556   opls_140    105    MET    HG1    539       0.06      1.008
  1557   opls_140    105    MET    HG2    539       0.06      1.008
  1558   opls_202    105    MET     SD    540     -0.335      32.06
  1559   opls_209    105    MET     CE    541     -0.013     12.011
  1560   opls_140    105    MET    HE1    541       0.06      1.008
  1561   opls_140    105    MET    HE2    541       0.06      1.008
  1562   opls_140    105    MET    HE3    541       0.06      1.008
  1563   opls_235    105    MET      C    542        0.5     12.011
  1564   opls_236    105    MET      O    542       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 106 ASN rtp ASN  q  0.0
  1565   opls_238    106    ASN      N    543       -0.5    14.0067
  1566   opls_241    106    ASN      H    543        0.3      1.008
  1567  opls_224B    106    ASN     CA    544       0.14     12.011
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  1569   opls_136    106    ASN     CB    545      -0.12     12.011
  1570   opls_140    106    ASN    HB1    545       0.06      1.008
  1571   opls_140    106    ASN    HB2    545       0.06      1.008
  1572   opls_235    106    ASN     CG    546        0.5     12.011
  1573   opls_236    106    ASN    OD1    546       -0.5    15.9994
  1574   opls_237    106    ASN    ND2    547      -0.76    14.0067
  1575   opls_240    106    ASN   HD21    547       0.38      1.008
  1576   opls_240    106    ASN   HD22    547       0.38      1.008
  1577   opls_235    106    ASN      C    548        0.5     12.011
  1578   opls_236    106    ASN      O    548       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 107 ALA rtp ALA  q  0.0
  1579   opls_238    107    ALA      N    549       -0.5    14.0067
  1580   opls_241    107    ALA      H    549        0.3      1.008
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  1583   opls_135    107    ALA     CB    550      -0.18     12.011
  1584   opls_140    107    ALA    HB1    550       0.06      1.008
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  1586   opls_140    107    ALA    HB3    550       0.06      1.008
  1587   opls_235    107    ALA      C    551        0.5     12.011
  1588   opls_236    107    ALA      O    551       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 108 TRP rtp TRP  q  0.0
  1589   opls_238    108    TRP      N    552       -0.5    14.0067
  1590   opls_241    108    TRP      H    552        0.3      1.008
  1591  opls_224B    108    TRP     CA    552       0.14     12.011
  1592   opls_140    108    TRP     HA    552       0.06      1.008
  1593   opls_136    108    TRP     CB    553      -0.12     12.011
  1594   opls_140    108    TRP    HB1    553       0.06      1.008
  1595   opls_140    108    TRP    HB2    553       0.06      1.008
  1596   opls_500    108    TRP     CG    554      0.075     12.011
  1597   opls_514    108    TRP    CD1    555     -0.115     12.011
  1598   opls_146    108    TRP    HD1    555      0.115      1.008
  1599   opls_501    108    TRP    CD2    556     -0.055     12.011
  1600   opls_503    108    TRP    NE1    557      -0.57    14.0067
  1601   opls_504    108    TRP    HE1    557       0.42      1.008
  1602   opls_502    108    TRP    CE2    557       0.13     12.011
  1603   opls_145    108    TRP    CE3    558     -0.115     12.011
  1604   opls_146    108    TRP    HE3    558      0.115      1.008
  1605   opls_145    108    TRP    CZ2    559     -0.115     12.011
  1606   opls_146    108    TRP    HZ2    559      0.115      1.008
  1607   opls_145    108    TRP    CZ3    560     -0.115     12.011
  1608   opls_146    108    TRP    HZ3    560      0.115      1.008
  1609   opls_145    108    TRP    CH2    561     -0.115     12.011
  1610   opls_146    108    TRP    HH2    561      0.115      1.008
  1611   opls_235    108    TRP      C    562        0.5     12.011
  1612   opls_236    108    TRP      O    562       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 109 VAL rtp VAL  q  0.0
  1613   opls_238    109    VAL      N    563       -0.5    14.0067
  1614   opls_241    109    VAL      H    563        0.3      1.008
  1615  opls_224B    109    VAL     CA    563       0.14     12.011
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  1617   opls_137    109    VAL     CB    564      -0.06     12.011
  1618   opls_140    109    VAL     HB    564       0.06      1.008
  1619   opls_135    109    VAL    CG1    565      -0.18     12.011
  1620   opls_140    109    VAL   HG11    565       0.06      1.008
  1621   opls_140    109    VAL   HG12    565       0.06      1.008
  1622   opls_140    109    VAL   HG13    565       0.06      1.008
  1623   opls_135    109    VAL    CG2    566      -0.18     12.011
  1624   opls_140    109    VAL   HG21    566       0.06      1.008
  1625   opls_140    109    VAL   HG22    566       0.06      1.008
  1626   opls_140    109    VAL   HG23    566       0.06      1.008
  1627   opls_235    109    VAL      C    567        0.5     12.011
  1628   opls_236    109    VAL      O    567       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 110 ALA rtp ALA  q  0.0
  1629   opls_238    110    ALA      N    568       -0.5    14.0067
  1630   opls_241    110    ALA      H    568        0.3      1.008
  1631  opls_224B    110    ALA     CA    568       0.14     12.011
  1632   opls_140    110    ALA     HA    568       0.06      1.008
  1633   opls_135    110    ALA     CB    569      -0.18     12.011
  1634   opls_140    110    ALA    HB1    569       0.06      1.008
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  1637   opls_235    110    ALA      C    570        0.5     12.011
  1638   opls_236    110    ALA      O    570       -0.5    15.9994   ; qtot 5
; residue 111 TRP rtp TRP  q  0.0
  1639   opls_238    111    TRP      N    571       -0.5    14.0067
  1640   opls_241    111    TRP      H    571        0.3      1.008
  1641  opls_224B    111    TRP     CA    571       0.14     12.011
  1642   opls_140    111    TRP     HA    571       0.06      1.008
  1643   opls_136    111    TRP     CB    572      -0.12     12.011
  1644   opls_140    111    TRP    HB1    572       0.06      1.008
  1645   opls_140    111    TRP    HB2    572       0.06      1.008
  1646   opls_500    111    TRP     CG    573      0.075     12.011
  1647   opls_514    111    TRP    CD1    574     -0.115     12.011
  1648   opls_146    111    TRP    HD1    574      0.115      1.008
  1649   opls_501    111    TRP    CD2    575     -0.055     12.011
  1650   opls_503    111    TRP    NE1    576      -0.57    14.0067
  1651   opls_504    111    TRP    HE1    576       0.42      1.008
  1652   opls_502    111    TRP    CE2    576       0.13     12.011
  1653   opls_145    111    TRP    CE3    577     -0.115     12.011
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; residue 112 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue 113 ASN rtp ASN  q  0.0
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; residue 114 ARG rtp ARG  q +1.0
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; residue 115 CYS rtp CYS2 q  0.0
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; residue 116 LYS rtp LYSH q +1.0
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; residue 117 GLY rtp GLY  q  0.0
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; residue 118 THR rtp THR  q  0.0
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; residue 119 ASP rtp ASP  q -1.0
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  1782   opls_274    119    ASP     CB    621      -0.22     12.011
  1783   opls_140    119    ASP    HB1    621       0.06      1.008
  1784   opls_140    119    ASP    HB2    621       0.06      1.008
  1785   opls_271    119    ASP     CG    622        0.7     12.011
  1786   opls_272    119    ASP    OD1    622       -0.8    15.9994
  1787   opls_272    119    ASP    OD2    622       -0.8    15.9994
  1788   opls_235    119    ASP      C    623        0.5     12.011
  1789   opls_236    119    ASP      O    623       -0.5    15.9994   ; qtot 7
; residue 120 VAL rtp VAL  q  0.0
  1790   opls_238    120    VAL      N    624       -0.5    14.0067
  1791   opls_241    120    VAL      H    624        0.3      1.008
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  1794   opls_137    120    VAL     CB    625      -0.06     12.011
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; residue 121 GLN rtp GLN  q  0.0
  1806   opls_238    121    GLN      N    629       -0.5    14.0067
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; residue 122 ALA rtp ALA  q  0.0
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; residue 123 TRP rtp TRP  q  0.0
  1833   opls_238    123    TRP      N    639       -0.5    14.0067
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  1839   opls_140    123    TRP    HB2    640       0.06      1.008
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; residue 124 ILE rtp ILE  q  0.0
  1857   opls_238    124    ILE      N    650       -0.5    14.0067
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; residue 125 ARG rtp ARG  q +1.0
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  1883   opls_308    125    ARG     CG    658      -0.05     12.011
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  1885   opls_140    125    ARG    HG2    658       0.06      1.008
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  1887   opls_140    125    ARG    HD1    659       0.06      1.008
  1888   opls_140    125    ARG    HD2    659       0.06      1.008
  1889   opls_303    125    ARG     NE    660       -0.7    14.0067
  1890   opls_304    125    ARG     HE    660       0.44      1.008
  1891   opls_302    125    ARG     CZ    660       0.64     12.011
  1892   opls_300    125    ARG    NH1    661       -0.8    14.0067
  1893   opls_301    125    ARG   HH11    661       0.46      1.008
  1894   opls_301    125    ARG   HH12    661       0.46      1.008
  1895   opls_300    125    ARG    NH2    662       -0.8    14.0067
  1896   opls_301    125    ARG   HH21    662       0.46      1.008
  1897   opls_301    125    ARG   HH22    662       0.46      1.008
  1898   opls_235    125    ARG      C    663        0.5     12.011
  1899   opls_236    125    ARG      O    663       -0.5    15.9994   ; qtot 8
; residue 126 GLY rtp GLY  q  0.0
  1900   opls_238    126    GLY      N    664       -0.5    14.0067
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  1905   opls_235    126    GLY      C    665        0.5     12.011
  1906   opls_236    126    GLY      O    665       -0.5    15.9994   ; qtot 8
; residue 127 CYS rtp CYS2 q  0.0
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 1959  1958  1960     1 

[ dihedrals ]
;  ai    aj    ak    al funct            c0            c1            c2            c3            c4            c5
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  409   408   410   420     3 
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  558   551   553   556     3    dih_SER_THR_chi1_CO_C_C_O
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  553   551   558   560     3 
  551   553   556   557     3    dih_SER_THR_chi2_C_C_OH_HO
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  572   562   564   567     3    dih_ASN_chi1_C_C_C_CO
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  595   594   596   606     3 
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  594   596   598   600     3 
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 1195  1180  1182  1187     3    dih_ILE_chi1_C_C_C_CO
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 1479  1464  1466  1471     3    dih_ILE_chi1_C_C_C_CO
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 1495  1483  1485  1491     3    dih_VAL_chi1_C_C_C_CO
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 1540  1539  1541  1543     3 
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 1549  1548  1550  1563     3 
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 1566  1565  1567  1569     3 
 1566  1565  1567  1577     3 
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 1577  1567  1569  1572     3    dih_ASN_chi1_C_C_C_CO
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 1599  1603  1607  1609     3 
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 1927  1930  1932  1933     3 
 1927  1930  1932  1936     3 
 1931  1930  1932  1933     3 
 1931  1930  1932  1936     3 
 1930  1932  1933  1934     3 
 1930  1932  1933  1935     3 
 1936  1932  1933  1934     3 
 1936  1932  1933  1935     3 
 1930  1932  1936  1937     3 
 1930  1932  1936  1938     3 
 1933  1932  1936  1937     3 
 1933  1932  1936  1938     3 
 1919  1939  1941  1942     3 
 1919  1939  1941  1943     3 
 1940  1939  1941  1942     3 
 1940  1939  1941  1943     3 
 1939  1941  1943  1944     3 
 1939  1941  1943  1945     3 
 1939  1941  1943  1958     3 
 1942  1941  1943  1944     3 
 1942  1941  1943  1945     3 
 1942  1941  1943  1958     3 
 1941  1943  1945  1948     3    dih_LEU_chi1_N_C_C_C
 1958  1943  1945  1948     3    dih_LEU_chi1_C_C_C_CO
 1941  1943  1945  1946     3 
 1941  1943  1945  1947     3 
 1944  1943  1945  1946     3 
 1944  1943  1945  1947     3 
 1944  1943  1945  1948     3 
 1958  1943  1945  1946     3 
 1958  1943  1945  1947     3 
 1941  1943  1958  1959     3 
 1941  1943  1958  1960     3 
 1944  1943  1958  1959     3 
 1944  1943  1958  1960     3 
 1945  1943  1958  1959     3 
 1945  1943  1958  1960     3 
 1943  1945  1948  1949     3 
 1943  1945  1948  1950     3 
 1943  1945  1948  1954     3 
 1946  1945  1948  1949     3 
 1946  1945  1948  1950     3 
 1946  1945  1948  1954     3 
 1947  1945  1948  1949     3 
 1947  1945  1948  1950     3 
 1947  1945  1948  1954     3 
 1945  1948  1950  1951     3 
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 1945  1948  1950  1953     3 
 1949  1948  1950  1951     3 
 1949  1948  1950  1952     3 
 1949  1948  1950  1953     3 
 1954  1948  1950  1951     3 
 1954  1948  1950  1952     3 
 1954  1948  1950  1953     3 
 1945  1948  1954  1955     3 
 1945  1948  1954  1956     3 
 1945  1948  1954  1957     3 
 1949  1948  1954  1955     3 
 1949  1948  1954  1956     3 
 1949  1948  1954  1957     3 
 1950  1948  1954  1955     3 
 1950  1948  1954  1956     3 
 1950  1948  1954  1957     3 

[ dihedrals ]
;  ai    aj    ak    al funct            c0            c1            c2            c3
    5    25    23    24     1    improper_O_C_X_Y
   23    27    25    26     1    improper_Z_N_X_Y
   27    41    39    40     1    improper_O_C_X_Y
   39    43    41    42     1    improper_Z_N_X_Y
   43    61    59    60     1    improper_O_C_X_Y
   45    48    51    49     1    improper_Z_CA_X_Y
   48    53    49    50     1    improper_Z_CA_X_Y
   48    55    51    52     1    improper_Z_CA_X_Y
   49    57    53    54     1    improper_Z_CA_X_Y
   51    57    55    56     1    improper_Z_CA_X_Y
   53    55    57    58     1    improper_Z_CA_X_Y
   59    63    61    62     1    improper_Z_N_X_Y
   63    68    66    67     1    improper_O_C_X_Y
   66    70    68    69     1    improper_Z_N_X_Y
   70    92    90    91     1    improper_O_C_X_Y
   78    83    81    82     1    improper_Z_N_X_Y
   81    84    83    87     1    improper_O_C_X_Y
   83    85    84    86     1    improper_Z_N_X_Y
   83    88    87    89     1    improper_Z_N_X_Y
   90    94    92    93     1    improper_Z_N_X_Y
   94   102   100   101     1    improper_O_C_X_Y
  100   104   102   103     1    improper_Z_N_X_Y
  104   117   115   116     1    improper_O_C_X_Y
  109   113   112   114     1    improper_O_C_X_Y
  115   119   117   118     1    improper_Z_N_X_Y
  119   136   134   135     1    improper_O_C_X_Y
  134   138   136   137     1    improper_Z_N_X_Y
  138   146   144   145     1    improper_O_C_X_Y
  144   148   146   147     1    improper_Z_N_X_Y
  148   156   154   155     1    improper_O_C_X_Y
  154   158   156   157     1    improper_Z_N_X_Y
  158   166   164   165     1    improper_O_C_X_Y
  164   168   166   167     1    improper_Z_N_X_Y
  168   183   181   182     1    improper_O_C_X_Y
  181   185   183   184     1    improper_Z_N_X_Y
  185   205   203   204     1    improper_O_C_X_Y
  203   207   205   206     1    improper_Z_N_X_Y
  207   229   227   228     1    improper_O_C_X_Y
  215   220   218   219     1    improper_Z_N_X_Y
  218   221   220   224     1    improper_O_C_X_Y
  220   222   221   223     1    improper_Z_N_X_Y
  220   225   224   226     1    improper_Z_N_X_Y
  227   231   229   230     1    improper_Z_N_X_Y
  231   246   244   245     1    improper_O_C_X_Y
  233   236   238   237     1    improper_Z_CA_X_Y
  236   242   238   239     1    improper_Z_CA_X_Y
  237   242   240   241     1    improper_Z_CA_X_Y
  240   238   242   243     1    improper_Z_N_X_Y
  244   248   246   247     1    improper_Z_N_X_Y
  248   253   251   252     1    improper_O_C_X_Y
  251   255   253   254     1    improper_Z_N_X_Y
  255   272   270   271     1    improper_O_C_X_Y
  270   274   272   273     1    improper_Z_N_X_Y
  274   284   282   283     1    improper_O_C_X_Y
  276   280   279   281     1    improper_O_C_X_Y
  282   286   284   285     1    improper_Z_N_X_Y
  286   298   296   297     1    improper_O_C_X_Y
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  291   294   293   295     1    improper_Z_N_X_Y
  296   300   298   299     1    improper_Z_N_X_Y
  300   319   317   318     1    improper_O_C_X_Y
  302   305   308   306     1    improper_Z_CA_X_Y
  305   310   306   307     1    improper_Z_CA_X_Y
  305   312   308   309     1    improper_Z_CA_X_Y
  306   314   310   311     1    improper_Z_CA_X_Y
  308   314   312   313     1    improper_Z_CA_X_Y
  310   312   314   315     1    improper_Z_CA_X_Y
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  321   343   341   342     1    improper_O_C_X_Y
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  332   335   334   338     1    improper_O_C_X_Y
  334   336   335   337     1    improper_Z_N_X_Y
  334   339   338   340     1    improper_Z_N_X_Y
  341   345   343   344     1    improper_Z_N_X_Y
  345   350   348   349     1    improper_O_C_X_Y
  348   352   350   351     1    improper_Z_N_X_Y
  352   371   369   370     1    improper_O_C_X_Y
  354   357   360   358     1    improper_Z_CA_X_Y
  357   362   358   359     1    improper_Z_CA_X_Y
  357   364   360   361     1    improper_Z_CA_X_Y
  358   366   362   363     1    improper_Z_CA_X_Y
  360   366   364   365     1    improper_Z_CA_X_Y
  362   364   366   367     1    improper_Z_CA_X_Y
  369   373   371   372     1    improper_Z_N_X_Y
  373   382   380   381     1    improper_O_C_X_Y
  380   384   382   383     1    improper_Z_N_X_Y
  384   401   399   400     1    improper_O_C_X_Y
  399   403   401   402     1    improper_Z_N_X_Y
  403   408   406   407     1    improper_O_C_X_Y
  406   410   408   409     1    improper_Z_N_X_Y
  410   422   420   421     1    improper_O_C_X_Y
  412   417   415   416     1    improper_O_C_X_Y
  415   418   417   419     1    improper_Z_N_X_Y
  420   424   422   423     1    improper_Z_N_X_Y
  424   446   444   445     1    improper_O_C_X_Y
  426   429   432   430     1    improper_Z_CA_X_Y
  429   433   430   431     1    improper_Z_CA_X_Y
  430   435   433   434     1    improper_Z_N_X_Y
  435   442   438   439     1    improper_Z_CA_X_Y
  437   436   432   440     1    improper_Z_CA_X_Y
  438   440   442   443     1    improper_Z_CA_X_Y
  441   440   436   442     1    improper_Z_CA_X_Y
  444   448   446   447     1    improper_Z_N_X_Y
  448   462   460   461     1    improper_O_C_X_Y
  460   464   462   463     1    improper_Z_N_X_Y
  464   472   470   471     1    improper_O_C_X_Y
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  474   482   480   481     1    improper_O_C_X_Y
  480   484   482   483     1    improper_Z_N_X_Y
  484   492   490   491     1    improper_O_C_X_Y
  490   494   492   493     1    improper_Z_N_X_Y
  494   514   512   513     1    improper_O_C_X_Y
  512   516   514   515     1    improper_Z_N_X_Y
  516   534   532   533     1    improper_O_C_X_Y
  518   521   524   522     1    improper_Z_CA_X_Y
  521   526   522   523     1    improper_Z_CA_X_Y
  521   528   524   525     1    improper_Z_CA_X_Y
  522   530   526   527     1    improper_Z_CA_X_Y
  524   530   528   529     1    improper_Z_CA_X_Y
  526   528   530   531     1    improper_Z_CA_X_Y
  532   536   534   535     1    improper_Z_N_X_Y
  536   549   547   548     1    improper_O_C_X_Y
  541   545   544   546     1    improper_O_C_X_Y
  547   551   549   550     1    improper_Z_N_X_Y
  551   560   558   559     1    improper_O_C_X_Y
  558   562   560   561     1    improper_Z_N_X_Y
  562   574   572   573     1    improper_O_C_X_Y
  564   569   567   568     1    improper_O_C_X_Y
  567   570   569   571     1    improper_Z_N_X_Y
  572   576   574   575     1    improper_Z_N_X_Y
  576   594   592   593     1    improper_O_C_X_Y
  578   581   584   582     1    improper_Z_CA_X_Y
  581   586   582   583     1    improper_Z_CA_X_Y
  581   588   584   585     1    improper_Z_CA_X_Y
  582   590   586   587     1    improper_Z_CA_X_Y
  584   590   588   589     1    improper_Z_CA_X_Y
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  592   596   594   595     1    improper_Z_N_X_Y
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 1518  1522  1520  1521     1    improper_Z_N_X_Y
 1522  1527  1525  1526     1    improper_O_C_X_Y
 1525  1529  1527  1528     1    improper_Z_N_X_Y
 1529  1541  1539  1540     1    improper_O_C_X_Y
 1531  1536  1534  1535     1    improper_O_C_X_Y
 1534  1537  1536  1538     1    improper_Z_N_X_Y
 1539  1543  1541  1542     1    improper_Z_N_X_Y
 1543  1548  1546  1547     1    improper_O_C_X_Y
 1546  1550  1548  1549     1    improper_Z_N_X_Y
 1550  1565  1563  1564     1    improper_O_C_X_Y
 1563  1567  1565  1566     1    improper_Z_N_X_Y
 1567  1579  1577  1578     1    improper_O_C_X_Y
 1569  1574  1572  1573     1    improper_O_C_X_Y
 1572  1575  1574  1576     1    improper_Z_N_X_Y
 1577  1581  1579  1580     1    improper_Z_N_X_Y
 1581  1589  1587  1588     1    improper_O_C_X_Y
 1587  1591  1589  1590     1    improper_Z_N_X_Y
 1591  1613  1611  1612     1    improper_O_C_X_Y
 1593  1596  1599  1597     1    improper_Z_CA_X_Y
 1596  1600  1597  1598     1    improper_Z_CA_X_Y
 1597  1602  1600  1601     1    improper_Z_N_X_Y
 1602  1609  1605  1606     1    improper_Z_CA_X_Y
 1604  1603  1599  1607     1    improper_Z_CA_X_Y
 1605  1607  1609  1610     1    improper_Z_CA_X_Y
 1608  1607  1603  1609     1    improper_Z_CA_X_Y
 1611  1615  1613  1614     1    improper_Z_N_X_Y
 1615  1629  1627  1628     1    improper_O_C_X_Y
 1627  1631  1629  1630     1    improper_Z_N_X_Y
 1631  1639  1637  1638     1    improper_O_C_X_Y
 1637  1641  1639  1640     1    improper_Z_N_X_Y
 1641  1663  1661  1662     1    improper_O_C_X_Y
 1643  1646  1649  1647     1    improper_Z_CA_X_Y
 1646  1650  1647  1648     1    improper_Z_CA_X_Y
 1647  1652  1650  1651     1    improper_Z_N_X_Y
 1652  1659  1655  1656     1    improper_Z_CA_X_Y
 1654  1653  1649  1657     1    improper_Z_CA_X_Y
 1655  1657  1659  1660     1    improper_Z_CA_X_Y
 1658  1657  1653  1659     1    improper_Z_CA_X_Y
 1661  1665  1663  1664     1    improper_Z_N_X_Y
 1665  1687  1685  1686     1    improper_O_C_X_Y
 1673  1678  1676  1677     1    improper_Z_N_X_Y
 1676  1679  1678  1682     1    improper_O_C_X_Y
 1678  1680  1679  1681     1    improper_Z_N_X_Y
 1678  1683  1682  1684     1    improper_Z_N_X_Y
 1685  1689  1687  1688     1    improper_Z_N_X_Y
 1689  1701  1699  1700     1    improper_O_C_X_Y
 1691  1696  1694  1695     1    improper_O_C_X_Y
 1694  1697  1696  1698     1    improper_Z_N_X_Y
 1699  1703  1701  1702     1    improper_Z_N_X_Y
 1703  1725  1723  1724     1    improper_O_C_X_Y
 1711  1716  1714  1715     1    improper_Z_N_X_Y
 1714  1717  1716  1720     1    improper_O_C_X_Y
 1716  1718  1717  1719     1    improper_Z_N_X_Y
 1716  1721  1720  1722     1    improper_Z_N_X_Y
 1723  1727  1725  1726     1    improper_Z_N_X_Y
 1727  1735  1733  1734     1    improper_O_C_X_Y
 1733  1737  1735  1736     1    improper_Z_N_X_Y
 1737  1757  1755  1756     1    improper_O_C_X_Y
 1755  1759  1757  1758     1    improper_Z_N_X_Y
 1759  1764  1762  1763     1    improper_O_C_X_Y
 1762  1766  1764  1765     1    improper_Z_N_X_Y
 1766  1778  1776  1777     1    improper_O_C_X_Y
 1776  1780  1778  1779     1    improper_Z_N_X_Y
 1780  1790  1788  1789     1    improper_O_C_X_Y
 1782  1786  1785  1787     1    improper_O_C_X_Y
 1788  1792  1790  1791     1    improper_Z_N_X_Y
 1792  1806  1804  1805     1    improper_O_C_X_Y
 1804  1808  1806  1807     1    improper_Z_N_X_Y
 1808  1823  1821  1822     1    improper_O_C_X_Y
 1813  1818  1816  1817     1    improper_O_C_X_Y
 1816  1819  1818  1820     1    improper_Z_N_X_Y
 1821  1825  1823  1824     1    improper_Z_N_X_Y
 1825  1833  1831  1832     1    improper_O_C_X_Y
 1831  1835  1833  1834     1    improper_Z_N_X_Y
 1835  1857  1855  1856     1    improper_O_C_X_Y
 1837  1840  1843  1841     1    improper_Z_CA_X_Y
 1840  1844  1841  1842     1    improper_Z_CA_X_Y
 1841  1846  1844  1845     1    improper_Z_N_X_Y
 1846  1853  1849  1850     1    improper_Z_CA_X_Y
 1848  1847  1843  1851     1    improper_Z_CA_X_Y
 1849  1851  1853  1854     1    improper_Z_CA_X_Y
 1852  1851  1847  1853     1    improper_Z_CA_X_Y
 1855  1859  1857  1858     1    improper_Z_N_X_Y
 1859  1876  1874  1875     1    improper_O_C_X_Y
 1874  1878  1876  1877     1    improper_Z_N_X_Y
 1878  1900  1898  1899     1    improper_O_C_X_Y
 1886  1891  1889  1890     1    improper_Z_N_X_Y
 1889  1892  1891  1895     1    improper_O_C_X_Y
 1891  1893  1892  1894     1    improper_Z_N_X_Y
 1891  1896  1895  1897     1    improper_Z_N_X_Y
 1898  1902  1900  1901     1    improper_Z_N_X_Y
 1902  1907  1905  1906     1    improper_O_C_X_Y
 1905  1909  1907  1908     1    improper_Z_N_X_Y
 1909  1917  1915  1916     1    improper_O_C_X_Y
 1915  1919  1917  1918     1    improper_Z_N_X_Y
 1919  1941  1939  1940     1    improper_O_C_X_Y
 1927  1932  1930  1931     1    improper_Z_N_X_Y
 1930  1933  1932  1936     1    improper_O_C_X_Y
 1932  1934  1933  1935     1    improper_Z_N_X_Y
 1932  1937  1936  1938     1    improper_Z_N_X_Y
 1939  1943  1941  1942     1    improper_Z_N_X_Y
 1943  1959  1958  1960     1    improper_O_C_X_Y

; Include Position restraint file
#ifdef POSRES
#include "posre.itp"
#endif

; Include water topology
#include "oplsaa.ff/spce.itp"

#ifdef POSRES_WATER
; Position restraint for each water oxygen
[ position_restraints ]
;  i funct       fcx        fcy        fcz
   1    1       1000       1000       1000
#endif

; Include topology for ions
#include "oplsaa.ff/ions.itp"

[ system ]
; Name
LYSOZYME in water

[ molecules ]
; Compound        #mols
Protein_chain_A     1
SOL             10644