marvin2018_A
- Pobieramy dokument - template do odpowiedzi
- Sprawdzamy na liście obecności, jaka struktura została nam przydzielona (w formacie SMILES)
- Wypełniamy tabelę w dokumencie odpowiedzi
- Odpowiadamy na pytania.
- Odpowiedzi wysyłamy na adres:
.
⚠️ typowe wartości pH w różnych obszarach przewodu pokarmowego pokazane są na rysunku na dole tej strony; proszę przyjąć dolne wartości zakresów.- 💡 Wykonanie zrzutu ekranu: Ctrl+PrtScr
Życzę powodzenia! 👍
Dla cząsteczki, której SMILES są podane na liście obecności, proszę policzyć:
- pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (załączyć rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych form w zależności od pH
- Czy związek ma szansę wchłaniać się w jamie ustnej, żołądku, jelitach? Odpowiedź krótko uzasadnić.
- Dla wartości pH typowych dla śliny, żołądka, jelita proszę:
- Policzyć logD w tych pH; podać wartości oraz załączyć odpowiednie wizualizacje
- Policzyć PSA (polar surface area 2D)
- Policzyć rozpuszczalność w wodzie:
- pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
- ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?
- Wyznaczyć kilka niskoenergetycznych konformacji cząsteczki ("conformers"), zapisać je w pliku SDF (w jednym pliku) (nie trzeba nic wklejać do dokumentu tekstowego)
(Za: Review of in vitro digestion models for rapid screening of emulsion-based systems, David Julian McClements and Yan Lia, Food Funct., 2010,1, 32-59)