marvin cwiczenia2016
Odpowiedzi proszę wklejać do dokumentu Office, który po zakończonej pracy należy wysłać na mój adres mailowy
Narysować cząsteczkę taką jak na rysunku. Zwrócić uwagę na atomy "na nóżkach" (rodniki? izotopy?)
Dla cząsteczki, której SMILES są podane na liście obecności, policzyć:
-
pKa wszystkich grup których to może dotyczyć (rysunek); dołączyć odpowiedni wykres udziału poszczególnych cząsteczek w zależności od pH
-
Wyszukać wartości pH typowe dla śliny, żołądka, jelita (hint: google "pH digestive tract")
-
Jakie formy (major microspecies) będą dominować przy pH w tych miejscach?
-
rozpuszczalność w wodzie:
- do jakiej kategorii należy dany związek? (Solubility category)
- pokazać wykres zależności rozpuszczalności (w mg/ml!) od pH
- ile wynosi rozpuszczalność (mg/ml!) w pH śliny, żołądka, jelita?
-
logP, logD, TPSA (polar surface area), wraz z odpowiednimi wizualizacjami -
liczbę HBA i HBD w pH=2 i pH=12. dołączyć odpowiedni wykres zależności od pH -
Wyznaczyć możliwe struktury rezonansowe. Dołączyć odpowiedni rysunek.