rnatoprot.py

#!/bin/python
with open('test.fasta','r') as f:
	seq =f.readline().strip().split()
	seq = str(seq[0])
	liste =[]
	final= []
	for i in range(len(seq)):
		if i%3 ==0:
			liste.append(seq[i:i+3])
	gencode = {
    'AUA':'I', 'AUC':'I', 'AUU':'I', 'AUG':'M',
    'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACU':'T',
    'AAC':'N', 'AAU':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
    'AGC':'S', 'AGU':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
    'CUA':'L', 'CUC':'L', 'CUG':'L', 'CUU':'L',
    'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCU':'P',
    'CAC':'H', 'CAU':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
    'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGU':'R',
    'GUA':'V', 'GUC':'V', 'GUG':'V', 'GUU':'V',
    'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCU':'A',
    'GAC':'D', 'GAU':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
    'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGU':'G',
    'UCA':'S', 'UCC':'S', 'UCG':'S', 'UCU':'S',
    'UUC':'F', 'UUU':'F', 'UUA':'L', 'UUG':'L',
    'UAC':'Y', 'UAU':'Y', 'UAA':'_', 'UAG':'_',
    'UGC':'C', 'UGU':'C', 'UGA':'_', 'UGG':'W'}
	for i in liste:
		x =gencode.get(i)
		final.append(x)
	print(''.join(final))