Skip to content

Commit

Permalink
Use HTML codes for åäö
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
@samuell
samuell committed Oct 11, 2024
1 parent 1d3e907 commit c301d63
Show file tree
Hide file tree
Showing 3 changed files with 79 additions and 79 deletions.
4 changes: 2 additions & 2 deletions microSALT/server/templates/STtracker_page.html
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -17,7 +17,7 @@ <h3>Kontakt Clinical Genomics</h3>
<address>
<strong>Clinical Genomics</strong><br>
Science for Life Laboratory<br>
Tomtebodavägen 23<br>
Tomtebodav&auml;gen 23<br>
171 65 Solna<br>
<abbr title="Telefonnummer">T:</abbr> (08) 524 81 500
</address>
Expand Down Expand Up @@ -57,6 +57,6 @@ <h3>Kontakt Clinical Genomics</h3>
</div>
</footer>
</div>
<div class="text-muted text-center">Slut på rapport</div>
<div class="text-muted text-center">Slut p&aring; rapport</div>
</div>
{% endblock %}
56 changes: 28 additions & 28 deletions microSALT/server/templates/alignment_page.html
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -23,7 +23,7 @@ <h3>Kontakt</h3>
<address>
<strong>Clinical Genomics</strong><br>
Science for Life Laboratory<br>
Tomtebodavägen 23<br>
Tomtebodav&auml;gen 23<br>
171 65 Solna<br>
<abbr title="Telefonnummer">T:</abbr> (08) 524 81 500
</address>
Expand All @@ -35,7 +35,7 @@ <h4>{{topsample.projects.Customer_ID}}</h4><br>
</address>
<address>
<strong>microSALT-teamet</strong><br>
<abbr title="Förslagslåda">E:</abbr><a href="mailto:microsalt-suggestions@scilifelab.se?subject=Förbättringsförslag">
<abbr title="F&ouml;rslagsl&aring;da">E:</abbr><a href="mailto:microsalt-suggestions@scilifelab.se?subject=F&ouml;rb&auml;ttringsf&ouml;rslag">
microsalt-suggestions@scilifelab.se
</a>
</address>
Expand All @@ -44,7 +44,7 @@ <h4>{{topsample.projects.Customer_ID}}</h4><br>
<br />

<div class="panel"><div class="panel-body">
<h3>Projektsammanställning<br></h3>
<h3>Projektsammanst&auml;llning<br></h3>
<div class="table-responsive"><table class="table table-bordered" style='table-layout:fixed;'>
<tr>
<td><b>Ticket ID <i>(CG Projekt ID)</i></b>
Expand All @@ -57,7 +57,7 @@ <h3>Projektsammanställning<br></h3>
<tr>
<td><b>Rapport version</b></td>
{% if reports|length > 1 %}
<td>Version {{reports[0].version}}, {{reports[0].date.date()}} (Ersätter version {{reports[1].version}}, {{reports[1].date.date()}})</td>
<td>Version {{reports[0].version}}, {{reports[0].date.date()}} (Ers&auml;tter version {{reports[1].version}}, {{reports[1].date.date()}})</td>
{% else %}
<td>Version {{reports[0].version}}, {{reports[0].date.date()}}</td>
{% endif %}
Expand All @@ -73,7 +73,7 @@ <h3>Projektsammanställning<br></h3>
</table></div>
</div></div>
<div class="panel"><div class="panel-body">
<h3>Provsammanställning<br></h3>
<h3>Provsammanst&auml;llning<br></h3>
<div class="table-responsive">
<table class="table table-bordered" style='table-layout:fixed;'>
<tr>
Expand All @@ -86,11 +86,11 @@ <h3>Provsammanställning<br></h3>
<th>Mappningsgrad %</th>
<th>Duplikationsgrad %</th>
<th>Insert Storlek (Median)</th>
<th>Medeltäckning</th>
<th>%BP > 10x Täckning</th>
<th>%BP > 30x Täckning</th>
<th>%BP > 50x Täckning</th>
<th>%BP > 100x Täckning</th>
<th>Medelt&auml;ckning</th>
<th>%BP > 10x T&auml;ckning</th>
<th>%BP > 30x T&auml;ckning</th>
<th>%BP > 50x T&auml;ckning</th>
<th>%BP > 100x T&auml;ckning</th>

</tr>
{% for sample in samples %}
Expand All @@ -105,7 +105,7 @@ <h3>Provsammanställning<br></h3>
{% endif %}
{% if sample.organism is not none %}
<td>{{sample.organism.replace('_', ' ').capitalize()}}</td>
{% else %}<td>Okänd</td>{% endif %}
{% else %}<td>Ok&auml;nd</td>{% endif %}
<td>{{ sample.reference_genome }}</td>

{% if sample.total_reads is none %}
Expand Down Expand Up @@ -210,53 +210,53 @@ <h3>Provsammanställning<br></h3>
{% endfor %}
</table>
</div>
(*) Information om prover som kommer från kund <br/>
(*) Information om prover som kommer fr&aring;n kund <br/>
</div></div>

<div class="panel"><div class="panel-body">
<h3>Teknisk beskrivning av analysen: {{topsample.application_tag}}<br></h3>
<p>
{% if topsample.application_tag == "MWRNXTR003" %}
Mikrobiell helgenomssekvensering av rutinprov, med krav på minst 3 miljoner läspar.
Mikrobiell helgenomssekvensering av rutinprov, med krav p&aring; minst 3 miljoner l&auml;spar.
Nextera library preparation.
{% elif topsample.application_tag in ["MWGNXTR003", "MWMNXTR003", "MWLNXTR003"] %}
Mikrobiell helgenomssekvensering, med krav på minst 3 miljoner läspar.
Mikrobiell helgenomssekvensering, med krav p&aring; minst 3 miljoner l&auml;spar.
Nextera library preparation.
{% elif topsample.application_tag == "MWXNXTR003" %}
Storskalig mikrobiell helgenomssekvensering av minst 176 prover, med krav på minst 3 miljoner läspar.
Storskalig mikrobiell helgenomssekvensering av minst 176 prover, med krav p&aring; minst 3 miljoner l&auml;spar.
Nextera library preparation.
{% elif topsample.application_tag in ["VWGNXTR001", "VWLNXTR001"] %}
Virologisk helgenomssekvensering, med krav på minst 1 miljon läspar.
Virologisk helgenomssekvensering, med krav p&aring; minst 1 miljon l&auml;spar.
Nextera library preparation.
{% endif %}
</p>
<h3>Analysbegränsningar för: {{topsample.application_tag}}<br></h3>
<h3>Analysbegr&auml;nsningar f&ouml;r: {{topsample.application_tag}}<br></h3>
<p>
Tillförlitligheten hos resultaten förutsätter att informationen som bifogats från kund är korrekt.
Tillf&ouml;rlitligheten hos resultaten f&ouml;ruts&auml;tter att informationen som bifogats fr&aring;n kund &auml;r korrekt.
</p>

<h3>Förbättringsförslag<br></h3>
<h3>F&ouml;rb&auml;ttringsf&ouml;rslag<br></h3>
<p>
Alla typer av förbättringsförslag mailas med fördel till microsalt-suggestions@scilifelab.se<br>
Din återkopplling uppskattas!
Alla typer av f&ouml;rb&auml;ttringsf&ouml;rslag mailas med f&ouml;rdel till microsalt-suggestions@scilifelab.se<br>
Din &aring;terkopplling uppskattas!
</p>

<h3>Avvikelser från metoden<br></h3>
<h3>Avvikelser fr&aring;n metoden<br></h3>
<p>
All kommunikation gällande ordern såsom tillägg, avvikelser eller
ev undantag i metoden från Clinical Genomics finns tillgängligt i
SupportSystem för dess ticket id. En stängd ticket kan närsomhelst
öppnas upp igen för frågor.
All kommunikation g&auml;llande ordern s&aring;som till&auml;gg, avvikelser eller
ev undantag i metoden fr&aring;n Clinical Genomics finns tillg&auml;ngligt i
SupportSystem f&ouml;r dess ticket id. En st&auml;ngd ticket kan n&auml;rsomhelst
&ouml;ppnas upp igen f&ouml;r fr&aring;gor.
</p>

<h3>Signatur för godkännande av rapport<br></h3>
<h3>Signatur f&ouml;r godk&auml;nnande av rapport<br></h3>
<p>
Valtteri Wirta<br>
Head of unit, Clinical Genomics
</p>
</div></div>
</div>
<div class="text-muted text-center">Slut på rapport</div>
<div class="text-muted text-center">Slut p&aring; rapport</div>
</div>
</footer>
</div>
Expand Down
Loading

0 comments on commit c301d63

Please sign in to comment.