diff --git a/CMakeLists.txt b/CMakeLists.txt index 9cc04d7..65b5118 100644 --- a/CMakeLists.txt +++ b/CMakeLists.txt @@ -12,4 +12,55 @@ endif() include_directories(3rdparty) -add_subdirectory(sln) +UNSET(Kokkos_DIR CACHE) +set(Kokkos_DIR 3rdparty/kokkos/build/) + +if(NOT DEFINED Kokkos_ENABLE_CONTAINERS) + set(Kokkos_ENABLE_CONTAINERS ON) +endif() + +if(NOT DEFINED Kokkos_ENABLE_ALL_PACKAGES) + set(Kokkos_ENABLE_ALL_PACKAGES ON) +endif() + +set(KOKKOS_SIMD_LIB "${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build/simd/src/libkokkossimd.a") +set(KOKKOS_CORE_LIB "${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build/core/src/libkokkoscore.a") +set(KOKKOS_CONTAINERS_LIB "${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build/containers/src/libkokkoscontainers.a") + +add_custom_command( + OUTPUT ${KOKKOS_CONTAINERS_LIB} + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E echo "Building Kokkos Containers Library" + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} --build ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build --target kokkoscontainers + DEPENDS ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos + COMMENT "Creating libkokkoscontainers.a" +) + +add_custom_target(create_kokkoscontainers ALL DEPENDS ${KOKKOS_CONTAINERS_LIB}) + +add_custom_command( + OUTPUT ${KOKKOS_SIMD_LIB} + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E echo "Building Kokkos SIMD Library" + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} --build ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build --target kokkossimd + DEPENDS ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos + COMMENT "Creating libkokkossimd.a" +) + +add_custom_target(create_kokkossimd ALL DEPENDS ${KOKKOS_SIMD_LIB}) + +add_custom_command( + OUTPUT ${KOKKOS_CORE_LIB} + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} -E echo "Building Kokkos Core Library" + COMMAND ${CMAKE_COMMAND} --build ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos/build --target kokkoscore + DEPENDS ${CMAKE_CURRENT_SOURCE_DIR}/3rdparty/kokkos + COMMENT "Creating libkokkoscore.a" +) + +add_custom_target(create_kokkoscore ALL DEPENDS ${KOKKOS_CORE_LIB}) + + +find_package(Kokkos REQUIRED) + +add_subdirectory(project) +add_subdirectory(test) +add_subdirectory(samples) + diff --git a/PlotScript/OutFiles_1/0.csv b/PlotScript/OutFiles_1/0.csv new file mode 100644 index 0000000..6b127ca --- /dev/null +++ b/PlotScript/OutFiles_1/0.csv @@ -0,0 +1,70 @@ +0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 +0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 +0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 +0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 +0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 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a/PlotScript/OutFiles_4/1.csv b/PlotScript/OutFiles_4/1.csv deleted file mode 100644 index 9cc3cb2..0000000 --- a/PlotScript/OutFiles_4/1.csv +++ /dev/null @@ -1,50 +0,0 @@ -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 -0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0;0 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applyPeriodicBoundary(int& i, int& j, int& k, int Ni, int Nj, int Nk) +{ + int i_isMinusOne = (i < 0); + int j_isMinusOne = (j < 0); + int k_isMinusOne = (k < 0); + + int i_isNi = (i == Ni); + int j_isNj = (j == Nj); + int k_isNk = (k == Nk); + + i = (Ni - 1) * i_isMinusOne + i * + !(i_isMinusOne || i_isNi); + j = (Nj - 1) * j_isMinusOne + j * + !(j_isMinusOne || j_isNj); + k = (Nk - 1) * k_isMinusOne + k * + !(k_isMinusOne || k_isNk); + +} + +// double PMLcoef(double sigma) +// { +// return std::exp(-sigma * dt * FDTDconst::C); +// } + +// class ComputeSigmaFunctor +// { +// private: +// double SGm; +// Function dist; +// int pml_size; +// Field EsigmaX, BsigmaX; +// public: +// ComputeSigmaXFunctor(Field _EsigmaX, Field _BsigmaX, double _SGm, Function distance, int _pml_size) : +// EsigmaX(_EsigmaX), BsigmaX(_BsigmaX), SGm(_SGm), dist(distance), pml_size(_pml_size) {}; + +// static void apply(Field _EsigmaX, Field _BsigmaX, double _SGm, Function distance, int _pml_size, +// int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2]) +// { +// ComputeSigmaXFunctor functor(_EsigmaX, _BsigmaX, _SGm, distance, _pml_size); +// Kokkos::parallel_for(Kokkos::MDRangePolicy>( +// { bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0] }, { bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1] }), +// functor); +// } + +// KOKKOS_INLINE_FUNCTION void operator()(const int& i, const int& j, const int& k) const +// { +// EsigmaX(i, j, k) = SGm * std::pow(static_cast(dist(i, j, k)) +// / static_cast(pml_size), FDTDconst::N); +// BsigmaX(i, j, k) = SGm * std::pow(static_cast(dist(i, j, k)) +// / static_cast(pml_size), FDTDconst::N); +// } +// }; + +class ComputeE_FieldFunctor +{ +private: + Field Ex, Ey, Ez; + Field Bx, By, Bz; + TimeField Jx, Jy, Jz; + double dt, dx, dy, dz; + int t, iters; + int Ni, Nj, Nk; +public: + ComputeE_FieldFunctor(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bx, Field By, Field Bz, + TimeField Jx, TimeField Jy, TimeField Jz, + double dt, double dx, double dy, double dz, int t, int iters, + int Ni, int Nj, int Nk) + : Ex(Ex), Ey(Ey), Ez(Ez), Bx(Bx), By(By), Bz(Bz), + Jx(Jx), Jy(Jy), Jz(Jz), dt(dt), dx(dx), dy(dy), dz(dz), t(t), iters(iters), + Ni(Ni), Nj(Nj), Nk(Nk) {} + + static void apply(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bx, Field By, Field Bz, + TimeField Jx, TimeField Jy, TimeField Jz, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2], int t, int iters, + int Ni, int Nj, int Nk) { + + ComputeE_FieldFunctor functor(Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz, Jx, Jy, Jz, dt, dx, dy, dz, t, iters, Ni, Nj, Nk); + + Kokkos::MDRangePolicy> policy({bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0]}, + {bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1]}); + + Kokkos::parallel_for("UpdateEField", policy, functor); + } + + KOKKOS_INLINE_FUNCTION void operator()(const int i, const int j, const int k) const + { + int i_pred = i - 1; + int j_pred = j - 1; + int k_pred = k - 1; + + applyPeriodicBoundary(i_pred, j_pred, k_pred, Ni, Nj, Nk); + + double Jx_val = (iters <= t) ? 0.0 : 4.0 * FDTDconst::PI * dt * Jx(t, i, j, k); + double Jy_val = (iters <= t) ? 0.0 : 4.0 * FDTDconst::PI * dt * Jy(t, i, j, k); + double Jz_val = (iters <= t) ? 0.0 : 4.0 * FDTDconst::PI * dt * Jz(t, i, j, k); + + Ex(i, j, k) += -Jx_val + FDTDconst::C * dt * ((Bz(i, j, k) - Bz(i, j_pred, k)) / dy - + (By(i, j, k) - By(i, j, k_pred)) / dz); + Ey(i, j, k) += -Jy_val + FDTDconst::C * dt * ((Bx(i, j, k) - Bx(i, j, k_pred)) / dz - + (Bz(i, j, k) - Bz(i_pred, j, k)) / dx); + Ez(i, j, k) += -Jz_val + FDTDconst::C * dt * ((By(i, j, k) - By(i_pred, j, k)) / dx - + (Bx(i, j, k) - Bx(i, j_pred, k)) / dy); + } +}; + +class ComputeB_FieldFunctor +{ +private: + Field Ex, Ey, Ez; + Field Bx, By, Bz; + double dt, dx, dy, dz; + int Ni, Nj, Nk; +public: + ComputeB_FieldFunctor(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bx, Field By, Field Bz, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int Ni, int Nj, int Nk) + : Ex(Ex), Ey(Ey), Ez(Ez), Bx(Bx), By(By), Bz(Bz), dt(dt), dx(dx), dy(dy), dz(dz), + Ni(Ni), Nj(Nj), Nk(Nk) {} + + static void apply(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bx, Field By, Field Bz, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2], int Ni, int Nj, int Nk) { + + ComputeB_FieldFunctor functor(Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz, dt, dx, dy, dz, Ni, Nj, Nk); + + Kokkos::MDRangePolicy> policy({bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0]}, + {bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1]}); + + Kokkos::parallel_for("UpdateBField", policy, functor); + } + + KOKKOS_INLINE_FUNCTION void operator()(const int i, const int j, const int k) const + { + int i_next = i + 1; + int j_next = j + 1; + int k_next = k + 1; + + applyPeriodicBoundary(i_next, j_next, k_next, Ni, Nj, Nk); + + Bx(i, j, k) += FDTDconst::C * dt / 2.0 * ((Ey(i, j, k_next) - Ey(i, j, k)) / dz - + (Ez(i, j_next, k) - Ez(i, j, k)) / dy); + By(i, j, k) += FDTDconst::C * dt / 2.0 * ((Ez(i_next, j, k) - Ez(i, j, k)) / dx - + (Ex(i, j, k_next) - Ex(i, j, k)) / dz); + Bz(i, j, k) += FDTDconst::C * dt / 2.0 * ((Ex(i, j_next, k) - Ex(i, j, k)) / dy - + (Ey(i_next, j, k) - Ey(i, j, k)) / dx); + } +}; + +class ComputeE_PML_FieldFunctor +{ +private: + Field Ex, Ey, Ez; + Field Exy, Eyx, Ezy, Eyz, Ezx, Exz; + Field Bx, By, Bz; + Field EsigmaX, EsigmaY, EsigmaZ; + double dt, dx, dy, dz; + int Ni, Nj, Nk; + + double PMLcoef(double sigma) const + { + return std::exp(-sigma * dt * FDTDconst::C); + } +public: + ComputeE_PML_FieldFunctor(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Exy, Field Eyx, Field Ezy, + Field Eyz, Field Ezx, Field Exz, + Field Bx, Field By, Field Bz, + Field EsigmaX, Field EsigmaY, Field EsigmaZ, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int Ni, int Nj, int Nk) + : Ex(Ex), Ey(Ey), Ez(Ez), Exy(Exy), Eyx(Eyx), Ezy(Ezy), + Eyz(Eyz), Ezx(Ezx), Exz(Exz), Bx(Bx), By(By), Bz(Bz), + EsigmaX(EsigmaX), EsigmaY(EsigmaY), EsigmaZ(EsigmaZ), + dt(dt), dx(dx), dy(dy), dz(dz), Ni(Ni), Nj(Nj), Nk(Nk) {} + + static void apply(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Exy, Field Eyx, Field Ezy, + Field Eyz, Field Ezx, Field Exz, + Field Bx, Field By, Field Bz, + Field EsigmaX, Field EsigmaY, Field EsigmaZ, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2], + int Ni, int Nj, int Nk) { + + ComputeE_PML_FieldFunctor functor(Ex, Ey, Ez, Exy, Eyx, Ezy, Eyz, Ezx, Exz, + Bx, By, Bz, EsigmaX, EsigmaY, EsigmaZ, + dt, dx, dy, dz, Ni, Nj, Nk); + + Kokkos::MDRangePolicy> policy({bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0]}, + {bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1]}); + + Kokkos::parallel_for("UpdateEPMLField", policy, functor); + } + + KOKKOS_INLINE_FUNCTION void operator()(const int i, const int j, const int k) const + { + int i_pred = i - 1; + int j_pred = j - 1; + int k_pred = k - 1; + + applyPeriodicBoundary(i_pred, j_pred, k_pred, Ni, Nj, Nk); + + double PMLcoef2_x, PMLcoef2_y, PMLcoef2_z; + + if (EsigmaX(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_x = (1.0 - PMLcoef(EsigmaX(i, j, k))) / (EsigmaX(i, j, k) * dx); + else + PMLcoef2_x = FDTDconst::C * dt / dx; + + if (EsigmaY(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_y = (1.0 - PMLcoef(EsigmaY(i, j, k))) / (EsigmaY(i, j, k) * dy); + else + PMLcoef2_y = FDTDconst::C * dt / dy; + + if (EsigmaZ(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_z = (1.0 - PMLcoef(EsigmaZ(i, j, k))) / (EsigmaZ(i, j, k) * dz); + else + PMLcoef2_z = FDTDconst::C * dt / dz; + + Eyx(i, j, k) = Eyx(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaX(i, j, k)) - + PMLcoef2_x * (Bz(i, j, k) - Bz(i_pred, j, k)); + Ezx(i, j, k) = Ezx(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaX(i, j, k)) + + PMLcoef2_x * (By(i, j, k) - By(i_pred, j, k)); + + Exy(i, j, k) = Exy(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaY(i, j, k)) + + PMLcoef2_y * (Bz(i, j, k) - Bz(i, j_pred, k)); + Ezy(i, j, k) = Ezy(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaY(i, j, k)) - + PMLcoef2_y * (Bx(i, j, k) - Bx(i, j_pred, k)); + + Exz(i, j, k) = Exz(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaZ(i, j, k)) - + PMLcoef2_z * (By(i, j, k) - By(i, j, k_pred)); + Eyz(i, j, k) = Eyz(i, j, k) * PMLcoef(EsigmaZ(i, j, k)) + + PMLcoef2_z * (Bx(i, j, k) - Bx(i, j, k_pred)); + + Ex(i, j, k) = Exz(i, j, k) + Exy(i, j, k); + Ey(i, j, k) = Eyx(i, j, k) + Eyz(i, j, k); + Ez(i, j, k) = Ezy(i, j, k) + Ezx(i, j, k); + } +}; + +class ComputeB_PML_FieldFunctor +{ +private: + Field Ex, Ey, Ez; + Field Bxy, Byx, Bzy, Byz, Bzx, Bxz; + Field Bx, By, Bz; + Field BsigmaX, BsigmaY, BsigmaZ; + double dt, dx, dy, dz; + int Ni, Nj, Nk; + + double PMLcoef(double sigma) const + { + return std::exp(-sigma * dt * FDTDconst::C); + } +public: + ComputeB_PML_FieldFunctor(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bxy, Field Byx, Field Bzy, + Field Byz, Field Bzx, Field Bxz, + Field Bx, Field By, Field Bz, + Field EsigmaX, Field EsigmaY, Field EsigmaZ, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int Ni, int Nj, int Nk) + : Ex(Ex), Ey(Ey), Ez(Ez), Bxy(Bxy), Byx(Byx), Bzy(Bzy), + Byz(Byz), Bzx(Bzx), Bxz(Bxz), Bx(Bx), By(By), Bz(Bz), + BsigmaX(BsigmaX), BsigmaY(BsigmaY), BsigmaZ(BsigmaZ), + dt(dt), dx(dx), dy(dy), dz(dz), Ni(Ni), Nj(Nj), Nk(Nk) {} + + static void apply(Field Ex, Field Ey, Field Ez, + Field Bxy, Field Byx, Field Bzy, + Field Byz, Field Bzx, Field Bxz, + Field Bx, Field By, Field Bz, + Field BsigmaX, Field BsigmaY, Field BsigmaZ, + double dt, double dx, double dy, double dz, + int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2], + int Ni, int Nj, int Nk) { + + ComputeB_PML_FieldFunctor functor(Ex, Ey, Ez, Bxy, Byx, Bzy, Byz, Bzx, Bxz, + Bx, By, Bz, BsigmaX, BsigmaY, BsigmaZ, + dt, dx, dy, dz, Ni, Nj, Nk); + + Kokkos::MDRangePolicy> policy({bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0]}, + {bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1]}); + + Kokkos::parallel_for("UpdateBPMLField", policy, functor); + } + + KOKKOS_INLINE_FUNCTION void operator()(const int i, const int j, const int k) const + { + int i_next = i + 1; + int j_next = j + 1; + int k_next = k + 1; + + applyPeriodicBoundary(i_next, j_next, k_next, Ni, Nj, Nk); + + double PMLcoef2_x, PMLcoef2_y, PMLcoef2_z; + + if (BsigmaX(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_x = (1.0 - PMLcoef(BsigmaX(i, j, k))) / (BsigmaX(i, j, k) * dx); + else + PMLcoef2_x = FDTDconst::C * dt / dx; + + if (BsigmaY(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_y = (1.0 - PMLcoef(BsigmaY(i, j, k))) / (BsigmaY(i, j, k) * dy); + else + PMLcoef2_y = FDTDconst::C * dt / dy; + + if (BsigmaZ(i, j, k) != 0.0) + PMLcoef2_z = (1.0 - PMLcoef(BsigmaZ(i, j, k))) / (BsigmaZ(i, j, k) * dz); + else + PMLcoef2_z = FDTDconst::C * dt / dz; + + Byx(i, j, k) = Byx(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaX(i, j, k)) + + PMLcoef2_x * (Ez(i_next, j, k) - Ez(i, j, k)); + Bzx(i, j, k) = Bzx(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaX(i, j, k)) - + PMLcoef2_x * (Ey(i_next, j, k) - Ey(i, j, k)); + + Bxy(i, j, k) = Bxy(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaY(i, j, k)) - + PMLcoef2_y * (Ez(i, j_next, k) - Ez(i, j, k)); + Bzy(i, j, k) = Bzy(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaY(i, j, k)) + + PMLcoef2_y * (Ex(i, j_next, k) - Ex(i, j, k)); + + Bxz(i, j, k) = Bxz(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaZ(i, j, k)) + + PMLcoef2_z * (Ey(i, j, k_next) - Ey(i, j, k)); + Byz(i, j, k) = Byz(i, j, k) * PMLcoef(BsigmaZ(i, j, k)) - + PMLcoef2_z * (Ex(i, j, k_next) - Ex(i, j, k)); + + Bx(i, j, k) = Bxy(i, j, k) + Bxz(i, j, k); + By(i, j, k) = Byz(i, j, k) + Byx(i, j, k); + Bz(i, j, k) = Bzx(i, j, k) + Bzy(i, j, k); + } +}; + + +class FDTD +{ +private: + Field Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz; + + TimeField Jx, Jy, Jz; + + Field Exy, Exz, Eyx, Eyz, Ezx, Ezy; + Field Bxy, Bxz, Byx, Byz, Bzx, Bzy; + + // Permittivity and permeability of the medium + Field EsigmaX, EsigmaY, EsigmaZ, + BsigmaX, BsigmaY, BsigmaZ; + + Parameters parameters; + CurrentParameters cParams; + double pml_percent, dt; + int pml_size_i, pml_size_j, pml_size_k; + std::function init_func; + + int time; + + void write_spherical(std::vector fields, Axis axis, std::string base_path, int it); + +public: + FDTD(Parameters _parameters, CurrentParameters _Cpar, double _dt, double _pml_percent, + std::function init_function, int time_); + + Field& get_field(Component); + + void update_fields(bool write_result = false, + Axis write_axis = Axis::X, std::string base_path = ""); +}; + + +FDTD::FDTD(Parameters _parameters, CurrentParameters _Cpar, double _dt, double _pml_percent, + std::function init_function, int time_) : + parameters(_parameters), cParams(_Cpar), dt(_dt), pml_percent(_pml_percent), init_func(init_function), time(time_) + +{ + if (parameters.Ni <= 0 || + parameters.Nj <= 0 || + parameters.Nk <= 0 || + dt <= 0) + { + throw std::invalid_argument("ERROR: invalid parameters"); + } + + Jx = TimeField("Jx", time, parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Jy = TimeField("Jy", time, parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Jz = TimeField("Jz", time, parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + Ex = Field("Ex", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Ey = Field("Ey", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Ez = Field("Ez", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Bx = Field("Bx", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + By = Field("By", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Bz = Field("Bz", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + Exy = Field("Exy", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Exz = Field("Exz", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Eyx = Field("Eyx", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Eyz = Field("Eyz", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Ezx = Field("Ezx", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Ezy = Field("Ezy", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + Bxy = Field("Bxy", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Bxz = Field("Bxz", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Byx = Field("Byx", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Byz = Field("Byz", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Bzx = Field("Bzx", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + Bzy = Field("Bzy", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + EsigmaX = Field("EsigmaX", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + EsigmaY = Field("EsigmaY", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + EsigmaZ = Field("EsigmaZ", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + BsigmaX = Field("BsigmaX", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + BsigmaY = Field("BsigmaY", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + BsigmaZ = Field("BsigmaZ", parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + pml_size_i = static_cast(static_cast(parameters.Ni) * pml_percent); + pml_size_j = static_cast(static_cast(parameters.Nj) * pml_percent); + pml_size_k = static_cast(static_cast(parameters.Nk) * pml_percent); +} + +Field& FDTD::get_field(Component this_field) +{ + switch (this_field) + { + case Component::EX: return Ex; + + case Component::EY: return Ey; + + case Component::EZ: return Ez; + + case Component::BX: return Bx; + + case Component::BY: return By; + + case Component::BZ: return Bz; + + default: throw std::logic_error("ERROR: Invalid field component"); + } +} + +class InitializeCurrentFunctor { +public: + + InitializeCurrentFunctor(TimeField J, CurrentParameters cParams, Parameters parameters, + std::function init_function) + : J(J), cParams(cParams), parameters(parameters), init_function(init_function) {} + + static void apply(TimeField J, CurrentParameters cParams, Parameters parameters, + std::function init_function, + int iterations, int bounds_i[2], int bounds_j[2], int bounds_k[2]) { + + InitializeCurrentFunctor functor(J, cParams, parameters, init_function); + + Kokkos::MDRangePolicy> policy({0, bounds_i[0], bounds_j[0], bounds_k[0]}, + {iterations, bounds_i[1], bounds_j[1], bounds_k[1]}); + + Kokkos::parallel_for("UpdateBPMLField", policy, functor); + } + + KOKKOS_INLINE_FUNCTION + void operator()(const int iter, const int i, const int j, const int k) const { + + J(iter, i, j, k) = init_function(static_cast(i) * parameters.dx, + static_cast(j) * parameters.dy, + static_cast(k) * parameters.dz, + static_cast(iter + 1) * cParams.dt); + } + +private: + TimeField J; + CurrentParameters cParams; + Parameters parameters; + std::function init_function; +}; + +void FDTD::update_fields(bool write_result, Axis write_axis, std::string base_path) +{ + if (time < 0) + { + throw std::invalid_argument("ERROR: Invalid update field argument"); + } + + double Tx = cParams.period_x; + double Ty = cParams.period_y; + double Tz = cParams.period_z; + + int start_i = static_cast(floor((-Tx / 4.0 - parameters.ax) / parameters.dx)); + int start_j = static_cast(floor((-Ty / 4.0 - parameters.ay) / parameters.dy)); + int start_k = static_cast(floor((-Tz / 4.0 - parameters.az) / parameters.dz)); + + int max_i = static_cast(floor((Tx / 4.0 - parameters.ax) / parameters.dx)); + int max_j = static_cast(floor((Ty / 4.0 - parameters.ay) / parameters.dy)); + int max_k = static_cast(floor((Tz / 4.0 - parameters.az) / parameters.dz)); + + int size_i_cur[2] = { start_i, max_i }; + int size_j_cur[2] = { start_j, max_j }; + int size_k_cur[2] = { start_k, max_k }; + + InitializeCurrentFunctor::apply(Jx, cParams, parameters, init_func, cParams.iterations, + size_i_cur, size_j_cur, size_k_cur); + InitializeCurrentFunctor::apply(Jy, cParams, parameters, init_func, cParams.iterations, + size_i_cur, size_j_cur, size_k_cur); + InitializeCurrentFunctor::apply(Jz, cParams, parameters, init_func, cParams.iterations, + size_i_cur, size_j_cur, size_k_cur); + + if (pml_percent == 0.0) + { + int size_i_main[2] = { 0, parameters.Ni }; + int size_j_main[2] = { 0, parameters.Nj }; + int size_k_main[2] = { 0, parameters.Nk }; + for (int t = 0; t < time; t++) + { + std::cout << "Iteration: " << t << std::endl; + + ComputeB_FieldFunctor::apply(Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz, dt, + parameters.dx, parameters.dy, parameters.dz, + size_i_main, size_j_main, size_k_main, + parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + ComputeE_FieldFunctor::apply(Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz, + Jx, Jy, Jz, dt, + parameters.dx, parameters.dy, parameters.dz, + size_i_main, size_j_main, size_k_main, t, cParams.iterations, + parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + ComputeB_FieldFunctor::apply(Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz, dt, + parameters.dx, parameters.dy, parameters.dz, + size_i_main, size_j_main, size_k_main, + parameters.Ni, parameters.Nj, parameters.Nk); + + auto Ex_host = Kokkos::create_mirror_view(Ex); + auto Ey_host = Kokkos::create_mirror_view(Ey); + auto Ez_host = Kokkos::create_mirror_view(Ez); + auto Bx_host = Kokkos::create_mirror_view(Bx); + auto By_host = Kokkos::create_mirror_view(By); + auto Bz_host = Kokkos::create_mirror_view(Bz); + + Kokkos::deep_copy(Ex_host, Ex); + Kokkos::deep_copy(Ey_host, Ey); + Kokkos::deep_copy(Ez_host, Ez); + Kokkos::deep_copy(Bx_host, Bx); + Kokkos::deep_copy(By_host, By); + Kokkos::deep_copy(Bz_host, Bz); + + std::vector return_data{ Ex_host, Ey_host, Ez_host, Bx_host, By_host, Bz_host }; + if (write_result) + write_spherical(return_data, write_axis, base_path, t); + } + return; + } + + // // Defining areas of computation + // int size_i_main[] = { pml_size_i, parameters.Ni - pml_size_i }; + // int size_j_main[] = { pml_size_j, parameters.Nj - pml_size_j }; + // int size_k_main[] = { pml_size_k, parameters.Nk - pml_size_k }; + + // int size_i_solid[] = { 0, parameters.Ni }; + // int size_j_solid[] = { 0, parameters.Nj }; + // int size_k_solid[] = { 0, parameters.Nk }; + + // int size_i_part_from_start[] = { 0, parameters.Ni - pml_size_i }; + // int size_i_part_from_end[] = { pml_size_i, parameters.Ni }; + + // int size_k_part_from_start[] = { 0, parameters.Nk - pml_size_k }; + // int size_k_part_from_end[] = { pml_size_k, parameters.Nk }; + + // int size_xy_lower_k_pml[] = { 0, pml_size_k }; + // int size_xy_upper_k_pml[] = { parameters.Nk - pml_size_k, parameters.Nk }; + + // int size_yz_lower_i_pml[] = { 0, pml_size_i }; + // int size_yz_upper_i_pml[] = { parameters.Ni - pml_size_i, parameters.Ni }; + + // int size_zx_lower_j_pml[] = { 0, pml_size_j }; + // int size_zx_upper_j_pml[] = { parameters.Nj - pml_size_j, parameters.Nj }; + + // // Definition of functions for calculating the distance to the interface + // std::function calc_distant_i_up = + // [=](int i, int j, int k) { + // return i + 1 + pml_size_i - parameters.Ni; + // }; + // std::function calc_distant_j_up = + // [=](int i, int j, int k) { + // return j + 1 + pml_size_j - parameters.Nj; + // }; + // std::function calc_distant_k_up = + // [=](int i, int j, int k) { + // return k + 1 + pml_size_k - parameters.Nk; + // }; + + // std::function calc_distant_i_low = + // [=](int i, int j, int k) { + // return pml_size_i - i; + // }; + // std::function calc_distant_j_low = + // [=](int i, int j, int k) { + // return pml_size_j - j; + // }; + // std::function calc_distant_k_low = + // [=](int i, int j, int k) { + // return pml_size_k - k; + // }; + + // // Calculation of maximum permittivity and permeability + // double SGm_x = -(FDTDconst::N + 1.0) / 2.0 * std::log(FDTDconst::R) + // / (static_cast(pml_size_i) * parameters.dx); + // double SGm_y = -(FDTDconst::N + 1.0) / 2.0 * std::log(FDTDconst::R) + // / (static_cast(pml_size_j) * parameters.dy); + // double SGm_z = -(FDTDconst::N + 1.0) / 2.0 * std::log(FDTDconst::R) + // / (static_cast(pml_size_k) * parameters.dz); + + // // Calculation of permittivity and permeability in the cells + // set_sigma_z(size_i_solid, size_j_solid, size_xy_lower_k_pml, + // SGm_z, calc_distant_k_low); + // set_sigma_y(size_i_solid, size_zx_lower_j_pml, size_k_solid, + // SGm_y, calc_distant_j_low); + // set_sigma_x(size_yz_lower_i_pml, size_j_solid, size_k_solid, + // SGm_x, calc_distant_i_low); + + // set_sigma_z(size_i_solid, size_j_solid, size_xy_upper_k_pml, + // SGm_z, calc_distant_k_up); + // set_sigma_y(size_i_solid, size_zx_upper_j_pml, size_k_solid, + // SGm_y, calc_distant_j_up); + // set_sigma_x(size_yz_upper_i_pml, size_j_solid, size_k_solid, + // SGm_x, calc_distant_i_up); + + // for (int t = 0; t < time; t++) + // { + // std::cout << "Iteration: " << t + 1 << std::endl; + + // update_B(size_i_main, size_j_main, size_k_main); + + // update_B_PML(size_i_part_from_start, size_j_solid, size_xy_lower_k_pml); + // update_B_PML(size_i_main, size_zx_lower_j_pml, size_k_main); + // update_B_PML(size_yz_lower_i_pml, size_j_solid, size_k_part_from_end); + + // update_B_PML(size_i_part_from_end, size_j_solid, size_xy_upper_k_pml); + // update_B_PML(size_i_main, size_zx_upper_j_pml, size_k_main); + // update_B_PML(size_yz_upper_i_pml, size_j_solid, size_k_part_from_start); + + // update_E(size_i_main, size_j_main, size_k_main, t); + + // update_E_PML(size_i_part_from_start, size_j_solid, size_xy_lower_k_pml); + // update_E_PML(size_i_main, size_zx_lower_j_pml, size_k_main); + // update_E_PML(size_yz_lower_i_pml, size_j_solid, size_k_part_from_end); + + // update_E_PML(size_i_part_from_end, size_j_solid, size_xy_upper_k_pml); + // update_E_PML(size_i_main, size_zx_upper_j_pml, size_k_main); + // update_E_PML(size_yz_upper_i_pml, size_j_solid, size_k_part_from_start); + + // update_B(size_i_main, size_j_main, size_k_main); + + // std::vector new_iteration{ Ex, Ey, Ez, Bx, By, Bz }; + // return_data = new_iteration; + // if (write_result) + // write_spherical(return_data, write_axis, base_path, t); + // } +} + + +void FDTD::write_spherical(std::vector fields, Axis axis, std::string base_path, int it) +{ + std::ofstream test_fout; + switch (axis) + { + case Axis::X: + { + for (int c = static_cast(Component::EX); c <= static_cast(Component::BZ); ++c) + { + test_fout.open(base_path + "OutFiles_" + std::to_string(c + 1) + "/" + std::to_string(it) + ".csv"); + Field field = fields[c]; + for (int k = 0; k < parameters.Nk; ++k) + { + for (int j = 0; j < parameters.Nj; ++j) + { + test_fout << field(parameters.Ni / 2, j, k); + if (j == parameters.Nj - 1) + { + test_fout << std::endl; + } + else + { + test_fout << ";"; + } + } + } + test_fout.close(); + } + break; + } + case Axis::Y: + { + for (int c = static_cast(Component::EX); c <= static_cast(Component::BZ); ++c) + { + test_fout.open(base_path + "OutFiles_" + std::to_string(c + 1) + "/" + std::to_string(it) + ".csv"); + Field field = fields[c]; + for (int i = 0; i < parameters.Nj; ++i) + { + for (int k = 0; k < parameters.Nk; ++k) + { + test_fout << field(i, parameters.Nj / 2, k); + if (k == parameters.Nk - 1) + { + test_fout << std::endl; + } + else + { + test_fout << ";"; + } + } + } + test_fout.close(); + } + break; + } + case Axis::Z: + { + for (int c = static_cast(Component::EX); c <= static_cast(Component::BZ); ++c) + { + test_fout.open(base_path + "OutFiles_" + std::to_string(c + 1) + "/" + std::to_string(it) + ".csv"); + Field field = fields[c]; + for (int i = 0; i < parameters.Nj; ++i) + { + for (int j = 0; j < parameters.Nk; ++j) + { + test_fout << field(i, j, parameters.Nk / 2); + if (j == parameters.Nk - 1) + { + test_fout << std::endl; + } + else + { + test_fout << ";"; + } + } + } + test_fout.close(); + } + break; + } + default: throw std::logic_error("ERROR: Invalid axis"); + } +} \ No newline at end of file diff --git a/include/FDTD_kokkos/Field_kokkos.h b/include/FDTD_kokkos/Field_kokkos.h new file mode 100644 index 0000000..e69de29 diff --git a/include/FDTD_kokkos/Writer_kokkos.h b/include/FDTD_kokkos/Writer_kokkos.h new file mode 100644 index 0000000..e69de29 diff --git a/include/FDTD_kokkos/test_FDTD_kokkos.h b/include/FDTD_kokkos/test_FDTD_kokkos.h new file mode 100644 index 0000000..e69de29 diff --git a/include/Structures.h b/include/Structures.h index 5ac42bc..a16733d 100644 --- a/include/Structures.h +++ b/include/Structures.h @@ -1,7 +1,5 @@ #pragma once -#include - namespace FDTDconst { const double C = 3e10; diff --git a/project/CMakeLists.txt b/project/CMakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..d8c161e --- /dev/null +++ b/project/CMakeLists.txt @@ -0,0 +1,4 @@ +include_directories(../include ../include/FDTD ../include/FDTD_kokkos ../src/FDTD ../src/FDTD_kokkos) + +add_subdirectory(FDTD) +add_subdirectory(FDTD_kokkos) \ No newline at end of file diff --git a/project/FDTD/CmakeLists.txt b/project/FDTD/CmakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..04c1979 --- /dev/null +++ b/project/FDTD/CmakeLists.txt @@ -0,0 +1,6 @@ +set(target "FDTD") + +file(GLOB hdrs "../../include/FDTD/*.h") +file(GLOB srcs "../../src/FDTD/*.cpp") + +add_library(${target} STATIC ${srcs} ${hdrs}) diff --git a/project/FDTD_kokkos/CMakeLists.txt b/project/FDTD_kokkos/CMakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..6f5089c --- /dev/null +++ b/project/FDTD_kokkos/CMakeLists.txt @@ -0,0 +1,8 @@ +set(target "FDTD_kokkos") + +file(GLOB hdrs "../../include/FDTD_kokkos/*.h") +file(GLOB srcs "../../src/FDTD_kokkos/*.cpp") + +add_library(${target} STATIC ${srcs} ${hdrs}) + +target_link_libraries(${target} Kokkos::kokkos) \ No newline at end of file diff --git a/samples/CMakeLists.txt b/samples/CMakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..bc5b0a9 --- /dev/null +++ b/samples/CMakeLists.txt @@ -0,0 +1,4 @@ +include_directories(../include ../include/FDTD ../include/FDTD_kokkos ../src/FDTD ../src/FDTD_kokkos) + +add_subdirectory(sample) +add_subdirectory(kokkos_sample) diff --git a/samples/kokkos_sample/CMakeLists.txt b/samples/kokkos_sample/CMakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..e43d2ea --- /dev/null +++ b/samples/kokkos_sample/CMakeLists.txt @@ -0,0 +1,18 @@ +file(GLOB hdrs "*../../include/*.h" "../../include/FDTD_kokkos/*.h") +file(GLOB srcs "*.cpp" "../../src/FDTD_kokkos/*.cpp" "kokkos_sample.cpp") + +add_executable(kokkos_sample ${srcs} ${hdrs}) + +if(WIN32) + set(output_dir "../../PlotScript/src") +else() + set(output_dir "../../PlotScript/src/Release") +endif() + +target_link_libraries(kokkos_sample Kokkos::kokkos) + +set_target_properties(kokkos_sample PROPERTIES RUNTIME_OUTPUT_DIRECTORY ${output_dir}) + +if(NOT EXISTS ${output_dir}) + file(MAKE_DIRECTORY ${output_dir}) +endif() diff --git a/samples/kokkos_sample/kokkos_sample.cpp b/samples/kokkos_sample/kokkos_sample.cpp new file mode 100644 index 0000000..7711b64 --- /dev/null +++ b/samples/kokkos_sample/kokkos_sample.cpp @@ -0,0 +1,121 @@ +#define _USE_MATH_DEFINES + +#include +#include +#include +#include +#include +#include +#include "FDTD_kokkos.h" + +// Функция для определения оси +Axis get_axis(Component field_E, Component field_B) +{ + Axis selected_axis; + if (field_E == Component::EY && field_B == Component::BZ || + field_E == Component::EZ && field_B == Component::BY) + { + selected_axis = Axis::X; + } + else if (field_E == Component::EX && field_B == Component::BZ || + field_E == Component::EZ && field_B == Component::BX) + { + selected_axis = Axis::Y; + } + else if (field_E == Component::EX && field_B == Component::BY || + field_E == Component::EY && field_B == Component::BX) + { + selected_axis = Axis::Z; + } + else + { + std::cout << "ERROR: invalid selected fields" << std::endl; + exit(1); + } + return selected_axis; +} + +// Основная функция для моделирования сферической волны +void spherical_wave(int n, int it, const char* base_path = "../../PlotScript/") +{ + // Параметры тока + CurrentParameters cur_param + { + 8, // period + 4, // period_x + 0.2 // dt + }; + + double T = cur_param.period; + double Tx = cur_param.period_x; + double Ty = cur_param.period_y; + double Tz = cur_param.period_z; + + cur_param.iterations = static_cast(static_cast(cur_param.period) / cur_param.dt); + + // Функция для тока + std::function cur_func = + [T, Tx, Ty, Tz](double x, double y, double z, double t) + { + return sin(2.0 * M_PI * t / T) + * pow(cos(2.0 * M_PI * x / Tx), 2.0) + * pow(cos(2.0 * M_PI * y / Ty), 2.0) + * pow(cos(2.0 * M_PI * z / Tz), 2.0); + }; + + // Инициализация параметров для FDTD + double d = FDTDconst::C; + double boundary = static_cast(n) / 2.0 * d; + + Parameters params + { + n, // Ni + n, // Nj + n, // Nk + -boundary, // x_min + boundary, // x_max + -boundary, // y_min + boundary, // y_max + -boundary, // z_min + boundary, // z_max + d, // dx + d, // dy + d // dz + }; + + FDTD method(params, cur_param, cur_param.dt, 0.0, cur_func, it); + + // Выполнение обновления полей + method.update_fields(true, Axis::Z, base_path); +} + +int main(int argc, char* argv[]) +{ + Kokkos::initialize(argc, argv); // Инициализация Kokkos + { + std::ifstream source_fin; + std::vector arguments(argv, argv + argc); + + // Выполнение с параметрами по умолчанию + if (argc == 1) + { + int N = 70; + int Iterations = 110; + spherical_wave(N, Iterations, "../../"); + } + // Выполнение с пользовательскими параметрами + else if (argc == 4) + { + int N = std::atoi(arguments[1]); + int Iterations = std::atoi(arguments[2]); + spherical_wave(N, Iterations, ""); + } + else + { + std::cout << "ERROR: Incorrect number of parameters" << std::endl; + exit(1); + } + } + Kokkos::finalize(); // Завершение Kokkos + return 0; +} \ No newline at end of file diff --git a/sln/sample/CMakeLists.txt b/samples/sample/CMakeLists.txt similarity index 72% rename from sln/sample/CMakeLists.txt rename to samples/sample/CMakeLists.txt index 1dd577d..b6954eb 100644 --- a/sln/sample/CMakeLists.txt +++ b/samples/sample/CMakeLists.txt @@ -1,5 +1,5 @@ -file(GLOB hdrs "*.h*" "../../include/*.h") -file(GLOB srcs "*.cpp" "../../src/*.cpp" "../../samples/*.cpp") +file(GLOB hdrs "*../../include/*.h" "../../include/FDTD/*.h") +file(GLOB srcs "*.cpp" "../../src/FDTD/*.cpp" "sample.cpp") add_executable(sample ${srcs} ${hdrs}) diff --git a/samples/sample.cpp b/samples/sample/sample.cpp similarity index 100% rename from samples/sample.cpp rename to samples/sample/sample.cpp diff --git a/sln/CMakeLists.txt b/sln/CMakeLists.txt deleted file mode 100644 index 56f1381..0000000 --- a/sln/CMakeLists.txt +++ /dev/null @@ -1,7 +0,0 @@ -include_directories(../include ../test) - -# BUILD -add_subdirectory(FDTD) -add_subdirectory(FDTD_test) -add_subdirectory(test_FDTD_method) -add_subdirectory(sample) diff --git a/sln/FDTD/CMakeLists.txt b/sln/FDTD/CMakeLists.txt deleted file mode 100644 index 170bf24..0000000 --- a/sln/FDTD/CMakeLists.txt +++ /dev/null @@ -1,3 +0,0 @@ -set(target "FDTD") - -add_library(${target} STATIC ../../include/FDTD.h ../../include/Field.h ../../include/Current.h ../../src/FDTD.cpp ../../src/Field.cpp ../../src/Current.cpp) diff --git a/sln/FDTD_test/CMakeLists.txt b/sln/FDTD_test/CMakeLists.txt deleted file mode 100644 index fa6f08d..0000000 --- a/sln/FDTD_test/CMakeLists.txt +++ /dev/null @@ -1,9 +0,0 @@ -set(target FDTD_test) - -file(GLOB hdrs "*.h*" "../../include/*.h") -#file(GLOB hdrs "*.h*") -file(GLOB srcs "*.cpp" "../../src/*.cpp") - -add_library(${target} ${srcs} ${hdrs}) - -add_compile_options(/wd4996) diff --git a/sln/test_FDTD_method/CMakeLists.txt b/sln/test_FDTD_method/CMakeLists.txt deleted file mode 100644 index df4abc1..0000000 --- a/sln/test_FDTD_method/CMakeLists.txt +++ /dev/null @@ -1,16 +0,0 @@ -set(target test_FDTD_method) - -set(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "${CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE} /MT") - -file(GLOB hdrs "*.h*" "../../include/*.h") -#file(GLOB hdrs "*.h*") -file(GLOB srcs "*.cpp" "../../src/*.cpp" "../../test/*.cpp") - -add_subdirectory(../../3rdparty/googletest ../../3rdparty/googletest/build EXCLUDE_FROM_ALL) - -add_executable(${target} ${srcs} ${hdrs}) -add_dependencies(${target} gtest) -target_link_directories(${target} PUBLIC ${CMAKE_BINARY_DIR}/googletest/lib) -target_link_libraries(${target} PUBLIC gtest gtest_main) - -add_compile_options(/wd4996) diff --git a/src/Current.cpp b/src/FDTD/Current.cpp similarity index 100% rename from src/Current.cpp rename to src/FDTD/Current.cpp diff --git a/src/FDTD.cpp b/src/FDTD/FDTD.cpp similarity index 100% rename from src/FDTD.cpp rename to src/FDTD/FDTD.cpp diff --git a/src/Field.cpp b/src/FDTD/Field.cpp similarity index 100% rename from src/Field.cpp rename to src/FDTD/Field.cpp diff --git a/src/Writer.cpp b/src/FDTD/Writer.cpp similarity index 100% rename from src/Writer.cpp rename to src/FDTD/Writer.cpp diff --git a/src/test_FDTD.cpp b/src/FDTD/test_FDTD.cpp similarity index 100% rename from src/test_FDTD.cpp rename to src/FDTD/test_FDTD.cpp diff --git a/src/FDTD_kokkos/Current_kokkos.cpp b/src/FDTD_kokkos/Current_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/src/FDTD_kokkos/Current_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ + diff --git a/src/FDTD_kokkos/FDTD_kokkos.cpp b/src/FDTD_kokkos/FDTD_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/src/FDTD_kokkos/FDTD_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ + diff --git a/src/FDTD_kokkos/Field_kokkos.cpp b/src/FDTD_kokkos/Field_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/src/FDTD_kokkos/Field_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ + diff --git a/src/FDTD_kokkos/Writer_kokkos.cpp b/src/FDTD_kokkos/Writer_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/src/FDTD_kokkos/Writer_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ + diff --git a/src/FDTD_kokkos/test_FDTD_kokkos.cpp b/src/FDTD_kokkos/test_FDTD_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/src/FDTD_kokkos/test_FDTD_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ + diff --git a/test/CMakeLists.txt b/test/CMakeLists.txt new file mode 100644 index 0000000..0d79e4b --- /dev/null +++ b/test/CMakeLists.txt @@ -0,0 +1,20 @@ +set(target test_FDTD_method) + +set(CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE "${CMAKE_CXX_FLAGS_RELEASE} /MT") + +include_directories(../include ../include/FDTD ../include/FDTD_kokkos ../src/FDTD ../src/FDTD_kokkos) + +file(GLOB hdrs "*../include/*.h" "../include/FDTD/*.h" "../include/FDTD_kokkos/*.h") +#file(GLOB hdrs "*.h*") +file(GLOB srcs "*.cpp" "../src/FDTD/*.cpp" "../src/FDTD_kokkos/*.cpp") + +add_subdirectory(../3rdparty/googletest ../3rdparty/googletest/build EXCLUDE_FROM_ALL) + +add_executable(${target} ${srcs} ${hdrs}) +add_dependencies(${target} gtest) +target_link_directories(${target} PUBLIC ${CMAKE_BINARY_DIR}/googletest/lib) +target_link_libraries(${target} PUBLIC gtest gtest_main) + +#target_link_libraries(${target} Kokkos::kokkos) + +add_compile_options(/wd4996) diff --git a/test/test_FDTD_method_kokkos.cpp b/test/test_FDTD_method_kokkos.cpp new file mode 100644 index 0000000..8b13789 --- /dev/null +++ b/test/test_FDTD_method_kokkos.cpp @@ -0,0 +1 @@ +